Licence Sciences de la vie

Les différents thèmes abordés en cours magistral concernent les acides nucléiques (ADN, ARN), les protéines, les glucides et les lipides. Dans chaque cas leurs structures, leurs propriétés et leurs assemblages in vivo, seront présentés aux étudiants, le tout en relation avec leurs différents rôles biologiques.

Au cours des séances de travaux dirigés, les étudiant travailleront sur différents exercices leur permettant de détailler et d’approfondir les notions abordées en cours. De plus, une part conséquente des travaux dirigés sera consacrée à des rappels importants sur les calculs de concentration ainsi que sur la spectrométrie.

Au cours des séances de travaux pratiques, les étudiants s’initient aux matériels et aux techniques de laboratoire en réalisant deux électrophorèses d’une part d’acides nucléiques, et d’autre part de protéines.

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L’enseignement porte sur l’atomistique, la liaison chimique et la cristallochimie. La première partie concerne la constitution et la représentation de l'atome. Le modèle quantique est introduit avec les notions d'orbitales atomiques associées. Les propriétés de l'atome sont mises en relation avec la configuration électronique et la place de l'élément dans la classification périodique.

La seconde partie concerne la représentation de la molécule avec le modèle de Lewis et la méthode VSEPR. Pour les édifices diatomiques covalents, on introduit le modèle des orbitales moléculaires issu de combinaisons linéaires d'orbitales atomiques. La dernière partie est une introduction à la périodicité des réseaux cristallins et description des structures métalliques compacts et ioniques simples du système cubique.

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Il s'agit d'une UE d'initiation à la démarche expérimentale dans le domaine de la chimie et de la biochimie. Elle est centrée sur des séances de travaux pratiques durant lesquelles les étudiants seront amenés à réaliser des expériences suite à un travail de préparation en séances de TD. Il s'agira en particulier de préparer des solutions chimiques, de réaliser des dosages par spectrophotométrie et des titrages acido-basiques. Tout au long du semestre, les étudiants seront sensibilisés à la bonne tenue d'un cahier de laboratoire.

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  Enseignement Transversal au Choix (ETC)

  Formation Bureautique et Internet (FBI)

1. Enseignement Transversal au Choix (ETC)

Diffusion des savoirs

Réflexion à propos des sciences et histoire des sciences

Développement et engagement personnel

Connaissance du monde professionnel, entrepreneuriat, orientation et insertion professionnelle

Langues (dont Français Langue Étrangère non Erasmus)

Sport

2. Formation Bureautique et Internet (FBI)

Développer et perfectionner vos compétences numériques

Vous préparer à affronter les défis élémentaires d'un monde de plus en plus digital

Travailler les cinq domaines de compétences numériques (selon le référentiel européen DIGCOMP) en s'appuyant sur la plate-forme française Pix (https://pix.fr/) :

- Informations et données

- Communication et collaboration

- Création de contenu

- Protection et sécurité

- Environnement numérique

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Il s'agit de quelques rappels sur des notions enseignées au collège et au lycée pour s'assurer que les étudiants disposent des outils mathématiques indispensables pour la suite de leur formation en Sciences de la vie. L'enseignement privilégiera les aspects pratiques et calculatoires plutôt que théoriques. Il abordera les notions de logique, de fractions, de puissances, de pourcentages, les fonctions usuelles, les vecteurs et matrices ainsi que les systèmes d’équations linéaires. Ces notions seront très utiles pour l’UE de mathématiques proposée au second semestre et qui introduit la biologie mathématique et l’étude de la dynamique des populations mais aussi pour toutes les autres UE (biologie, chimie, physique, statistique, informatique, ...) de la Licence.

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Il s'agit d'une initiation aux outils numériques utilisés en Sciences de la Vie. Les étudiants seront amenés à se familiariser avec le vocabulaire informatique et la formulation d'algorithmes pour résoudre des problèmes en biologie. Ces apprentissages seront mis en œuvre lors de séances de travaux pratiques sur ordinateur.

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Il s'agit d'une UE de découverte des Sciences de la terre. Les notions enseignées concernent la Terre dans le système solaire, l'eau à la surface de la planète Terre, le système climatique et les séismes terrestres. Les notions enseignées en cours seront renforcées lors de séances de TD incluant des analyses de résultats expérimentaux, des analyses de documents et l'utilisation d'outils numériques de simulation.

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Dans la première partie du semestre, les concepts de l'électricité (la force électrique, le champ électrique, l'énergie électrique et le potentiel électrique) sont introduits en insistant sur les raisons historiques et pratiques justifiant ces concepts. Ils sont mis en application dans des problèmes en lien avec la chimie et la biologie afin d'illustrer comment utiliser ces concepts et dans quels cas leur faire appel. On utilisera par exemple l'énergie électrique pour déterminer les conformations de molécules alors que les forces seront plus adaptées à l'étude des mouvements.

La deuxième partie du semestre est dédiée à l'étude des mouvements des charges sous l'effet d'un champ électrique. L'objectif est ici de comprendre en détail l'électrophorèse. On décrit aussi les phénomènes de diffusion à l’œuvre dans cette expérience. 

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Il s'agit d'une UE dispensant les bases de la biologie cellulaire. Elles concernent en particulier la structure des cellules eucaryote (animale ou végétale) ou procaryote et les méthodes d'observation associées, le mode de division de ces cellules, les principales étapes des voies de biosynthèse des molécules organiques et leur localisation sub-cellulaire, ainsi que les principes de base du métabolisme cellulaire.

En séance de TD, les étudiants travaillent sur des exercices leur permettant de détailler et d’approfondir les notions abordées en cours notamment grâce à des exercices d’analyse de résultats expérimentaux et à la réalisation de schémas de synthèse. Tout au long du semestre, l'interaction entre étudiants est privilégiée par la réalisation de travail en îlot et/ou face à la classe.

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Cette UE aborde les bases de la biologie des organismes animaux et végétaux, ainsi que les grands principes de l'évolution de ces organismes. Les thèmes abordés concernent l’organisation fonctionnelle et la reproduction des plantes supérieures (angiospermes), les grands plans d'organisation du règne animal, les principes et mécanismes généraux de l’évolution biologique et les adaptations à l’environnement comme source de biodiversité.

Les notions abordées en cours sont retravaillées en TD en particulier en ce qui concerne les grandes fonctions biologiques du règne animal et la construction d'arbres phylogénétiques.

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Cette UE vise à introduire l'utilisation de la lumière comme moyen d'investigation de la matière, en se basant sur des applications utiles pour la biologie, la chimie ou les sciences de la terre. Il s'agira d'appliquer des principes fondamentaux pour prédire le comportement d'un système et d'acquérir des notions de base nécessaires à la compréhension de phénomènes essentiels dans de nombreux domaines scientifiques. Les thèmes aborder concernent l'optique géométrique et les phénomènes optiques, les instruments d’optiques et d'acquisition d’image et leurs limites ainsi que la polarisation.

Les notions théoriques dispensées sous forme de Cours/TD seront approfondies lors de séances de travaux pratiques réalisés en binôme.

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Le but de cette UE est de présenter quelques outils de base du modélisateur et de l’utilisateur (éclairé) de modèles mathématiques, en s’appuyant principalement sur des applications en dynamique des populations. Le cours est consacré à des modèles déterministes de dynamique de populations.

On s’intéresse successivement aux modèles en temps discret, linéaires (que les biologistes appellent modèles de Malthus) ou affines, 1D puis 2D. Le cas 2D nous permet de rappeler et d’utiliser des outils d’algèbre linéaire de base concernant les matrices 2 × 2. On développe ensuite des outils efficaces, et relativement simples, permettant de déterminer le comportement qualitatif de nombreux modèles non linéaires, toujours en temps discret, et 1D uniquement (la situation en dimension supérieure étant redoutablement plus compliquée, dès la dimension 2, et hors d’atteinte pour ce cours).

Puis on aborde l’étude des modèles en temps continu, qui, bénéficiant de toute la puissance du calcul différentiel, se révèle par de nombreux aspects paradoxalement plus simple qu’en temps discret. De nouveau, on résout complètement les modèles linéaires (de Malthus) et affines 1D, puis 2D. On adapte au temps continu les outils qualitatifs développés pour le temps discret, ce qui permet de traiter relativement aisément tous les modèles non linéaires 1D et tous les modèles 2D linéaires ou affines.

On effectue des rappels sur les bases mathématiques nécessaires à l’étude des modèles envisagés, au fur et à mesure et selon les besoins, et la majeure partie des séances est dévolue à la résolution de nombreux exercices.

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Il s'agit d'une UE d'apprentissage à la reconnaissance des objets et des structures visibles à la surface de la Terre ainsi qu'à l'interprétation des paysages géologiques. Les notions abordées en cours magistral concernent en particulier la géomorphologie et la pétrographie. Les séances de TD consistent en des exercices d’application et des exposés oraux préparés par les étudiants sur des thématiques clés vues en cours.  Les séances de TP concernent la lecture de cartes topographiques et géologiques, l'interprétation de coupes géologiques et la reconnaissance des roches sédimentaires par observations macroscopiques. Enfin, les étudiants auront l'occasion de mettre en pratique les connaissances acquises lors d'une sortie sur le terrain.

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Cette UE de chimie générale est centrée sur la molécule et les premières notions de réactivité. Elle aborde l'hybridation et les représentations des molécules en détaillant les différentes classes d'isomères, mais aussi la mésomérie et les effets électroniques des groupements. Une partie de ces cours sera également consacrée aux complexes de coordination, comprenant leur stéréochimie, la théorie du champ cristallin et les échanges de ligands. Enfin, après une rapide présentation des principales fonctions chimiques et des règles de nomenclatures, un dernier chapitre sera dédié aux interactions intermoléculaires et à la réactivité en chimie avec plus précisément l'étude des réactions de substitution et d'élimination.

Les séances de TD seront consacrées essentiellement à des exercices d’application afin d’utiliser et appliquer les notions vues en cours magistraux. Une séance de TP consistera à manipuler des modèles moléculaires.

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Il s'agit d'une UE principalement expérimentale qui permet de mobiliser et de mettre en œuvre des connaissances acquises en biochimie (BIO101) et en biologie cellulaire (BIO201). Elle est organisée sous la forme d'une alternance de six séances de TD de préparation et de six séances de travaux pratiques. Les thèmes abordés sont en lien avec la biochimie des protéines (purification, analyse de structures quaternaires, dialyse) et des acides nucléiques (mise en évidence de mutations, carte de restriction) ainsi qu'avec la biologie cellulaire (osmose, notion de cellules isolées et de tissus, division cellulaire).

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Il s'agit d'une UE expérimentale en Biologie des organismes animaux et végétaux dont l'objectif est l'acquisition, par l'observation directe, des connaissances sur l'organisation fonctionnelle d'organismes animaux et végétaux dispensées dans l'UE BIO202. Elle vise aussi à former les étudiants dans les techniques de dissection, de coupes et colorations histologiques et d'observation microscopique. Elle consiste en l'étude du mode de vie et du fonctionnement de 4 animaux appartenant à des embranchements différents ainsi qu'en des études histologiques et anatomiques des organes des végétaux supérieurs.

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Il s'agit d'une UE d'initiation à la démarche expérimentale dans le domaine de la chimie et de la biochimie. Elle est centrée sur des séances de travaux pratiques durant lesquelles les étudiants seront amenés à réaliser des expériences suite à un travail de préparation en séances de TD. Il s'agira en particulier de préparer des solutions chimiques, de réaliser des dosages par spectrophotométrie et des titrages acido-basiques. Tout au long du semestre, les étudiants seront sensibilisés à la bonne tenue d'un cahier de laboratoire.

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  Enseignement Transversal au Choix (ETC)

  Formation Bureautique et Internet (FBI)

1. Enseignement Transversal au Choix (ETC)

Diffusion des savoirs

Réflexion à propos des sciences et histoire des sciences

Développement et engagement personnel

Connaissance du monde professionnel, entrepreneuriat, orientation et insertion professionnelle

Langues (dont Français Langue Étrangère non Erasmus)

Sport

2. Formation Bureautique et Internet (FBI)

Développer et perfectionner vos compétences numériques

Vous préparer à affronter les défis élémentaires d'un monde de plus en plus digital

Travailler les cinq domaines de compétences numériques (selon le référentiel européen DIGCOMP) en s'appuyant sur la plate-forme française Pix (https://pix.fr/) :

- Informations et données

- Communication et collaboration

- Création de contenu

- Protection et sécurité

- Environnement numérique

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The different topics covered in the lectures concern nucleic acids (DNA, RNA), proteins, carbohydrates and lipids. In each case their structures, properties and in vivo assemblies will be presented to the students, all in relation to their different biological roles.

During the tutorial sessions, students will work on different exercises allowing them to detail and deepen the notions discussed in class. In addition, a significant part of the tutorials will be devoted to important reminders on concentration calculations and spectrophotometry.

During the practical sessions, students are introduced to laboratory materials and techniques by carrying out two electrophoresis, one of nucleic acids and the other of proteins.

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Modern chemistry is a physical science and, as such, is ultimately based upon basic mathematical and physical principles. This first semester concentrates on the basic physical chemistry of electrons in atoms, molecular bonding and structure, and crystal structure. First, the basic notions of quantum mechanics and structure of the atom is introduced with emphasis on the energies and shapes of the atomic orbitals. This is used to build up the periodic table and to understand trends in the physical and chemical properties of elements. Then, it concentrates on the structure and bonding of diatomic and polyatomic molecules beginning with Lewis dot structures and the valence-shell electron pair repulsion (VSEPR) model for predicting geometries. The quantum mechanical description of bonding is explored via molecular orbital theory. Then this is followed by valence-bond (i.e., hybridization theory) for describing bonding in polyatomic molecules. Finally intermolecular forces are discussed with the aim of understanding trends in boiling points, melting points, and solubilities.

In parallel, the crystal structure part of the course treats the key mathematics needed to understand metallic and ionic crystals. For reasons of simplicity, only cubic lattices and the hexagonal closest packed (HCP) lattices are considered.

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This is a reminder of the concepts taught in secondary school to ensure that students have the mathematical tools they need to continue their training in life sciences. The teaching will focus on practical and computational aspNumber of credits rather than theoretical ones. It will cover the notions of logic, fractions, powers, percentages, usual functions, vectors and matrices as well as systems of linear equations. These notions will be very useful for the mathematics course offered in the second semester, which introduces mathematical biology and the study of population dynamics, but also for all the other courses (biology, chemistry, physics, statistics, computer science, etc.) of the Licence.

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In the first part of the semester, the concepts of electricity (electric force, electric field, electric energy and electric potential) are introduced with emphasis on the historical and practical reasons for these concepts. They are applied to problems related to chemistry and biology in order to illustrate how and when to use these concepts. For example, electrical energy will be used to determine the conformations of molecules, whereas forces will be more appropriate for the study of motion.

The second part of the semester is dedicated to the study of the movements of charges under the effect of an electric field. The objective here is to understand electrophoresis in detail. The diffusion phenomena at work in this experiment are also described.

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This is an introductory course in Earth Sciences. The notions taught concern the Earth in the solar system, water on the surface of the planet Earth, the climate system and earthquakes. The notions taught in class will be reinforced during the TD sessions including analysis of experimental results, analysis of documents and the use of numerical simulation tools.

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This is an introduction to the digital tools used in Life Sciences. Students will be introduced to computer vocabulary and the formulation of algorithms to solve problems in biology. This learning will be implemented during practical work sessions on computers.

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This is a course that provides the basics of cell biology. They concern in particular the structure of eukaryotic cells (animal or vegetable) or prokaryotic cells and the associated methods of observation, the mode of division of these cells, the principal stages of the biosynthetic pathways of the organic molecules and their sub-cellular localization, as well as the basic principles of cellular metabolism.

The students work on exercises that allow them to detail and deepen the notions covered in class, in particular through the analysis of experimental results and the creation of synthesis diagrams. Throughout the semester, interaction between students is favoured by working in groups and/or in front of the class.

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This course covers the basics of the biology of animal and plant organisms, as well as the main principles of the evolution of these organisms. The topics covered include the functional organisation and reproduction of higher plants (angiosperms), the major organisational plans of the animal kingdom, the general principles and mechanisms of biological evolution and environmental adaptations as a source of biodiversity.

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The aim of the course is to become familiar with some basic tools for the modeller and the informed user of mathematical models in the life sciences, limited to simple deterministic models of population dynamics and their applications.

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This module aims to introduce the use of light as a means of investigating matter, based on useful applications in biology, chemistry and earth sciences. The aim is to apply fundamental principles to predict the behaviour of a system and to acquire the basic notions necessary to understand essential phenomena in many scientific fields. The topics covered include geometric optics and optical phenomena, optical and image acquisition instruments and their limitations, and polarisation.

The theoretical notions taught in the form of lectures and tutorials will be further developed during practical work sessions carried out in pairs. 

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This course focuses on the molecule and the first notions of reactivity. It deals with hybridisation and representations of molecules by detailing the different classes of isomers, but also mesomerism and the electronic effNumber of credits of groups. A part of the course will also be devoted to coordination complexes, including their stereochemistry, crystal field theory and ligand exchange. Finally, after a quick presentation of the main chemical functions and nomenclature rules, a last chapter will be dedicated to intermolecular interactions and reactivity in chemistry with more precisely the study of substitution and elimination reactions.

The tutorial sessions will be mainly devoted to application exercises in order to use and apply the notions seen in lectures. One practical session will consist of manipulating molecular models.

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This is a mainly experimental course which allows the mobilisation and implementation of knowledge acquired in biochemistry (BIO101) and cell biology (BIO201). It is organised in the form of six alternating sessions of preparatory lectures and six sessions of practical work. The topics covered are related to the biochemistry of proteins (purification, analysis of quaternary structures, dialysis) and nucleic acids (identification of mutations, restriction map) as well as to cell biology (osmosis, concept of isolated cells and tissues, cell division).

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This is an experimental course in the Biology of animal and plant organisms, the objective of which is the acquisition, through direct observation, of the knowledge on the functional organisation of animal and plant organisms provided in the BIO202 course. It also aims to train students in the techniques of dissection, histological sections and staining and microscopic observation. It consists of the study of the way of life and the functioning of 4 animals belonging to different phyla as well as histological and anatomical studies of organs of higher plants.

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This course aims at the acquisition of a good knowledge of the functioning of eukaryotic and prokaryotic cells, which deals with all the major cellular functions (replication, transcription, translation, cytoskeleton, cell cycle, cell-environment interaction) and the experimental methods which allow their analysis.

The work of acquiring this knowledge in the TD session is carried out by interactive pedagogical methods (preparatory work, island work, oral presentation) in the form of actions that the students must carry out throughout the semester: oral retransmission of knowledge, application exercise, elaboration of MCQs, analysis of scientific figures, elaboration of a pedagogical creativity project.

In practical work, the student will have a first introduction to the experimental approaches of differential centrifugation, cell culture and luminescent immunolabelling.

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This is an introductory course to the concepts of genetics in prokaryotic and eukaryotic cells as well as in population genetics. In particular, it deals with the different mechanisms of horizontal gene transfer in bacteria and their use for genetic mapping. It also discusses the different types of Mendelian and non-Mendelian hybridism in eukaryotic organisms and describes examples in human genetics. Finally, it introduces the basic concepts of population genetics (Hardy-Weinberg principle, breeding regime and evolutionary forces). The acquisition of this knowledge will be worked on in practical exercises and the practical sessions will enable students to familiarise themselves with the basic techniques of bacterial genetics (transformation, selection, restriction map).

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This course deals with the kinetics and thermodynamics of chemical reactions in relation to biology. It deals in particular with reaction rates, enthalpies, entropy, thermodynamic cycles and goes into greater detail on the notions of acid/base. The concepts covered in the course are applied in the practical sessions via exercises and in the practical sessions through calorimetry and conductimetry experiments. 

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This course aims at acquiring the basics of descriptive and inferential statistics. It will deal in particular with methods of point estimation, estimation by confidence interval, and hypothesis testing in a parametric framework. The teaching in the form of lectures/tutorial is completed by practical work sessions on computer aimed at familiarising students with the handling of the R software for statistics.

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L'objectif de l'UE est de présenter les différents types d'interactions (symbiose, commensalisme, parasitisme) entre les bactéries et les organismes eucaryotes, animaux, protistes ou végétaux, ainsi que les moyens de visualiser l’évolution de ces interactions. Les thèmes développés seront les interactions entre bactéries et avec leur environnement, le microbiote intestinal humain (caractérisation, fonction), les bactéries pathogènes du tube digestif, la symbiose bactérie/plantes et les bactéries pathogènes chez les insectes.

Les séances de TD sont consacrées à l'analyse de données expérimentales en lien avec les thèmes abordés en cours.

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Cette UE vise à faire découvrir les particularités du règne végétal, ses potentialités en termes de synthèse de molécules (chimie verte), de génétique (sélection agronomique et modification génétique) et de production énergétique (valorisation de la biomasse).

Les cours (CM et TD) consistent à introduire ces notions et les techniques associées. Ils serviront de bases à un travail des étudiants sur des exemples d'applications récentes de valorisation des ressources végétales qu'ils présenteront oralement lors des séances TD/TP.

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Cette UE concerne les 2 modes de communication dans l'organisme des Mammifères que sont la communication nerveuse et la communication hormonale. Elle vise à faire comprendre la nécessité des régulations physiologiques pour maintenir l’homéostasie de l’organisme, à acquérir les notions de boucle de régulation et d'intégration de signaux de communication. Elle décrit en particulier le rôle de ces processus dans la thermorégulation.

Les notions dispensées en cours sont approfondies en TD sous forme d'exercices d'application ainsi que par l'analyse et la modélisation de données expérimentales.

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This course aims at acquiring the basics of enzymology (catalysis, Michaelis-Menten equation, catalysis mechanisms) and metabolism (glycolysis, Krebbs cycle, bacterial metabolism). The TD sessions consist of application exercises of the notions seen in class and the preparation of the TP sessions. The practical sessions concern the learning of the manipulation and characterization of enzymes (purification, spectroscopy). 

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This course covers both animal and plant physiology, integrating in both disciplines an experimental approach directly linked to the theoretical teaching. In animal physiology, it concerns the study of human physiological functions such as homeostasis, rest and action potential and muscular contraction.) The plant physiology part concerns the mineral and carbon nutrition of plants, as well as the development of Angiosperms and its regulation. The TD sessions consist of application exercises, analysis of experimental results and preparation of the TP sessions.

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Il s'agit d'une UE visant à la compréhension des concepts généraux et fondamentaux de l'écologie. Elle concerne en particulier les différents niveaux d'intégration en écologie (population, communauté, écosystème, biosphère), l'écologie des populations (dynamique des populations), des communautés (filtres historiques, biotiques et abiotiques et composition des communautés) et des écosystèmes (grands cycles biogéochimiques, écotoxicologie).

Les notions abordées sont approfondies en TD par des exercices d'applications et des analyses de résultats expérimentaux et en séance de TP dont une consiste en une sortie terrain.

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Overview of 12 different scientific topics in chemistry, biology or at the interface

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This course deals with the properties of water as a solvent in relation to biology. It deals in particular with the notion of pH and associated calculations, solubility and redox reactions. The notions seen in the course are deepened in TD by application exercises and in TP by potentiometric titration experiments.

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Dans cette UE, les étudiants travaillent en équipe de 5 à 7 sur 4 problématiques suivant un cycle méthodologique pour acquérir les outils de veille scientifique = « Challenge Méthodo » et trois cycles thematiques pour les utiliser = « Apprentissage Par Problème ». Chaque cycle comprend des conférences (4 à 6 « cours magistraux » selon les thèmes) et 5 séances de TD-tutorat dont les résultats sont présentés à l’écrit et à l’oral. Les 3 thèmes abordés constituant des ouvertures pouvant intéresser au-delà de l’UE, les cours-conférences ont été placés sur un créneau de milieu de journée afin de les rendre accessibles au personnel, enseignants et étudiants de la Licence Science et Technologie. Il s'agit d'une UE professionnalisante dans la mesure où les compétences développées et évaluées correspondent pour partie à celles attendues pour un responsable de veille scientifique et dans les métiers de la communication scientifique.

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The objective of this course is to introduce students to the conduct of an experimental project in biology on one of the three themes proposed, namely "Plants and light", "Control of diauxia by the lactose operon in Escherichia coli" or "Biochemical and functional characterization of a protein of interest". The students work in pairs with the help of two teachers during personalized tutorials allowing the construction of the project (framing of the problem, choice of experiments, selection of protocols, interpretation of results). They also benefit from self-training materials that introduce the methods of constructing an experimental plan and analyzing scientific data. The experimental projects are carried out in semi-autonomous conditions during a 5-day mini-internship in a laboratory. This is a professionalizing UE insofar as the skills developed and evaluated correspond in part to those expected for a project manager.

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Il s'agit d'une UE visant à l'acquisition d'une bonne connaissance du fonctionnement des cellules eucaryote et procaryote qui traite de toutes les grandes fonctions cellulaires (réplication, transcription, traduction, cytosquelette, cycle cellulaire, interaction cellule-environnement) et des méthodes expérimentales qui en permettent l'analyse.  

Le travail d'acquisition de ces connaissances en séance de TD est mené par des méthodes de pédagogie interactive (travail préparatoire, travail en îlot, présentation orale) sous forme d'actions que les étudiants doivent mener tout au long du semestre : retransmission orale des connaissances, exercice d'application, élaboration de QCM, analyse de figures scientifiques, élaboration d'un projet de créativité pédagogique.

En TP, l'étudiant aura une première initiation aux approches expérimentales de centrifugation différentielle, de culture cellulaire et d'immuno-marquage luminescent.

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Il s'agit d'une UE d'introduction aux notions de génétique chez les cellules procaryote et eucaryote ainsi qu'en génétique des populations. En particulier, elle traite des différents mécanismes de transfert horizontal de gènes chez les bactéries et leur utilisation pour la cartographie génétique. Elle traite aussi des différents types d'hybridisme mendélien et non mendélien chez les organismes eucaryotes et décrit des exemples en génétique humaine. Enfin, elle introduit les concepts de base en génétique des populations (principe d’Hardy-Weinberg, régime de reproduction et forces évolutives).

L'acquisition de ces connaissances sera travaillée en TD par des exercices d'application et les séances de TP permettront aux étudiants de se familiariser avec les techniques de bases en génétique bactérienne (transformation, sélection, carte de restriction).

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Il s'agit d'une UE visant à l'acquisition des bases de statistique descriptive et inférentielle. Elle traitera en particulier des méthodes d'estimation ponctuelle, d'estimation par intervalle de confiance, et de tests d'hypothèses dans un cadre paramétrique. Les enseignements sous forme de cours/TD sont complétés par des séances de travaux pratiques sur ordinateur visant à se familiariser avec la manipulation du logiciel R pour la statistique.

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Cette UE concerne la cinétique et la thermodynamique des réactions chimiques en lien avec la biologie. Elle traite en particulier des vitesses de réaction, des enthalpies, de l’entropie, des cycles thermodynamiques et revient de manière plus approfondie sur les notions d’acide/base. Les concepts abordés en cours sont appliqués en TD via des exercices et en TP par des expériences de calorimétrie et de conductimétrie.

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Cette UE concerne les 2 modes de communication dans l'organisme des Mammifères que sont la communication nerveuse et la communication hormonale. Elle vise à faire comprendre la nécessité des régulations physiologiques pour maintenir l’homéostasie de l’organisme, à acquérir les notions de boucle de régulation et d'intégration de signaux de communication. Elle décrit en particulier le rôle de ces processus dans la thermorégulation.

Les notions dispensées en cours sont approfondies en TD sous forme d'exercices d'application ainsi que par l'analyse et la modélisation de données expérimentales.

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Cette UE vise à faire découvrir les particularités du règne végétal, ses potentialités en termes de synthèse de molécules (chimie verte), de génétique (sélection agronomique et modification génétique) et de production énergétique (valorisation de la biomasse).

Les cours (CM et TD) consistent à introduire ces notions et les techniques associées. Ils serviront de bases à un travail des étudiants sur des exemples d'applications récentes de valorisation des ressources végétales qu'ils présenteront oralement lors des séances TD/TP.

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L'objectif de l'UE est de présenter les différents types d'interactions (symbiose, commensalisme, parasitisme) entre les bactéries et les organismes eucaryotes, animaux, protistes ou végétaux, ainsi que les moyens de visualiser l’évolution de ces interactions. Les thèmes développés seront les interactions entre bactéries et avec leur environnement, le microbiote intestinal humain (caractérisation, fonction), les bactéries pathogènes du tube digestif, la symbiose bactérie/plantes et les bactéries pathogènes chez les insectes.

Les séances de TD sont consacrées à l'analyse de données expérimentales en lien avec les thèmes abordés en cours.

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Il s'agit d'une UE visant l'acquisition des bases de l'enzymologie (catalyse, équation de Michaelis-Menten, mécanismes de catalyse) et du métabolisme (glycolyse, cycle de Krebbs, métabolisme bactérien).

Les séances de TD consistent en des exercices d'applications des notions vues en cours et en la préparation des séances de TP. Les séances de TP concernent l'apprentissage de la manipulation et de la caractérisation des enzymes (purification, spectroscopie).

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Cette UE aborde la physiologie animale et la physiologie végétale, en intégrant dans les deux disciplines une démarche expérimentale en lien direct avec l’enseignement théorique. En physiologie animale, elle concerne l'étude des fonctions physiologiques humaines telles que l'homéostasie, le potentiel de repos et d'action et la contraction musculaire). La partie physiologie végétale concerne la nutrition minérale et carbonée des plantes, ainsi que le développement des Angiospermes et sa régulation.

Les séances de TD consistent en des exercices d'applications, des analyses de résultats expérimentaux et en la préparation des séances de TP.

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Il s'agit d'une UE visant à la compréhension des concepts généraux et fondamentaux de l'écologie. Elle concerne en particulier les différents niveaux d'intégration en écologie (population, communauté, écosystème, biosphère), l'écologie des populations (dynamique des populations), des communautés (filtres historiques, biotiques et abiotiques et composition des communautés) et des écosystèmes (grands cycles biogéochimiques, écotoxicologie).

Les notions abordées sont approfondies en TD par des exercices d'applications et des analyses de résultats expérimentaux et en séance de TP dont une consiste en une sortie terrain.

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Cette UE concerne les propriétés de l'eau en tant que solvant en lien avec la biologie. Elle traite en particulier de la notion de pH et des calculs associés, de la solubilité et des réactions d'oxydoréduction. Les notions vues en cours sont approfondies en TD par des exercices d'applications et en TP par des expériences de titrage potentiométrique.

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L'objectif de l'UE est l'initiation à la conduite d'un projet expérimental en biologie sur l’un des 3 thèmes proposés, à savoir « Plantes et lumière », « Contrôle de la diauxie par l’opéron lactose chez Escherichia coli » ou « Caractérisation biochimique et fonctionnelle d’une protéine d’intérêt ». Les étudiants travaillent en binôme et avec l'aide de deux enseignants référents lors de tutorats personnalisés permettant la construction du projet (cadrage de la problématique, choix des expériences, sélection des protocoles, interprétation des résultats). Ils bénéficient aussi de supports d'autoformation introduisant les méthodes de construction d'un plan d'expériences et d'analyse de données scientifiques. Les projets expérimentaux sont réalisés en conditions de semi autonomie lors d'un mini-stage de 5 jours en salle de TP. Il s'agit d'une UE professionnalisante dans la mesure où les compétences développées et évaluées correspondent pour partie à celles attendues pour un chargé de projet.

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Dans cette UE, les étudiants travaillent en équipe de 5 à 7 sur 4 problématiques suivant un cycle méthodologique pour acquérir les outils de veille scientifique = « Challenge Méthodo » et trois cycles thematiques pour les utiliser = « Apprentissage Par Problème ». Chaque cycle comprend des conférences (4 à 6 « cours magistraux » selon les thèmes) et 5 séances de TD-tutorat dont les résultats sont présentés à l’écrit et à l’oral. Les 3 thèmes abordés constituant des ouvertures pouvant intéresser au-delà de l’UE, les cours-conférences ont été placés sur un créneau de milieu de journée afin de les rendre accessibles au personnel, enseignants et étudiants de la Licence Science et Technologie. Il s'agit d'une UE professionnalisante dans la mesure où les compétences développées et évaluées correspondent pour partie à celles attendues pour un responsable de veille scientifique et dans les métiers de la communication scientifique.

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Il s'agit d'une UE principalement expérimentale dont l'objectif est la formation des étudiants aux techniques actuelles utilisées couramment dans les domaines de la biochimie, de la biologie moléculaire, de la biologie cellulaire et de l'immunologie. Les séances de TP se déroulent dans des conditions (matériel, durée d'expérimentation) comparables à l'activité en laboratoire de biologie. Elles sont précédées et suivies par des séances de TD visant à accompagner les étudiants dans l'appréhension des protocoles techniques, dans la mise en forme et l'analyse de résultats expérimentaux.

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L'objectif de cette UE est la compréhension des processus cellulaires au niveau moléculaire détaillé. Il s'agit notamment d'étudier par le détail les structures des protéines, des acides nucléiques ainsi que les relations structure-fonction des biomolécules, la formation des complexes et les réactions chimiques impliquées dans certains processus eucaryotes. Les principales questions abordées sont (1) le monde de l'ARN : transcription et traduction, ARN non-codant, ARN enzymatique, dégradation des ARNs non-sens (2) les modifications post-traductionnelles comme la glycosylation, le rôle de l'ubiquitine, la phosphorylation (3) les mécanismes de transduction des signaux (4) les principes de conversion d'énergie et (5) l'enzymologie générale. Les TD complètent les cours et approfondissent tous les sujets traités en cours.

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L'objectif de cette UE est d'introduire les principes de modélisation formelle (mathématique, statistique et informatique) pour répondre à des questions biologiques et les outils permettant l'analyse des séquences biologiques. Il s'agit en particulier d'apprendre à modéliser les phénomènes biologiques, à tester des hypothèses à l’aide des outils statistiques et bio-informatiques. Les notions abordées en cours sont mises en oeuvre lors des séances TP sur ordinateur avec le logiciel de statistique R et les outils usuels de bio-informatique.

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L'objectif de cette UE est de consolider les connaissances de biologie cellulaire eucaryote et procaryote acquises en L1 et L2 et d'introduire les bases de l'immunologie. Il concerne en particulier la description des propriétés et des mécanismes de différentiation cellulaire chez les bactéries ainsi que chez les organismes eucaryotes uni et pluri-cellulaire. Les séances de TD servent à approfondir et illustrer les thèmes présentés dans les cours avec un accent particulier sur la compréhension des techniques et méthodes actuelles de biologie cellulaire.

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L'objectif de cette UE est de préparer l'étudiant à l’insertion professionnelle. Elle accompagne un travail personnel de l'étudiant visant à  mieux se connaître pour mieux savoir communiquer, à mieux connaître le monde professionnel pour identifier les attendus et à savoir synthétiser ces différents aspects en vue d'un entretien d'embauche.

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Le cours d'anglais en L3 s'appuie sur le travail d'initiation aux bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2 à l'UGA ou en IUT. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, écrire un résumé, écrire une introduction compte rendu de TP) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

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Vidéo de présentation de l'UE BIO 601

Les cours magistraux de cette UE abordent les interactions cellulaires dans les cellules normales et cancéreuse, le trafic cellulaire, la signalisation et la mécanotransduction, la prolifération et la mort cellulaire ainsi que la différenciation cellulaire et les cellules souches. Les techniques de visualisation du vivant seront revues autour des dernières avancées en microscopie photonique. Les TD concernent la signalisation cellulaire, l’apoptose, les interactions cellules-matrice extracellulaire, la croissance tumorale et les stratégies utilisées en microscopie à fluorescence. Ils décrivent précisément les techniques de biologie cellulaire comme la transfection de cellules de mammifères, l’ARN à interférence, l’immuno et co-immunoprécipitation, le système inductible tet-ON, les gènes rapporteurs in vitro et in vivo chez les eucaryotes supérieurs, les méthodes de mesure de la prolifération et de l’apoptose, les mesures physiques de la cellule. En TP, les étudiants étudient la structure et la fonction de deux types d’adhésome, adhésion focales et invadosome, exprimés dans les cellules normales et tumorales respectivement.

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Dans cette UE de physiologie, les fonctions vitales et les aspects bioénergétiques sont abordés selon 2 thèmes, comportant chacun un ensemble de CM, TD et TP. Le premier thème vise à comprendre comment l’organisme répond aux besoins fluctuants de toute cellule et comment les systèmes respiratoire et cardiovasculaire adaptent leur fonctionnement à la demande énergétique accrue lors de l’exercice physique (Illustration par un TP chez l’Homme). Dans le second thème, l’étude de la fonction digestive et de la régulation de la glycémie permet d’expliquer comment l’organisme puise les nutriments dans l’alimentation et acquière une certaine autonomie face à ses besoins nutritionnels. Cette UE, est aussi l’occasion de se familiariser avec l’expérimentation animale, par deux TP chez le rat, l’un à l’échelle de l’organe (étude de la contraction de l’intestin) et l’autre à l’échelle de l’organisme (mesure de glycémie).

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Cette UE traite des interactions entre les organismes et leur environnement à différents niveaux d’organisation fonctionnelle à partir d'exemples concernant les différents règnes du vivant et différents environnements contraints. Elle concerne en particulier les biomes et leurs contraintes (à travers l'exemple des biomes arctico-alpin, méditerranéen et désertique), les impacts de ces contraintes sur le fonctionnement d'un organisme (plante ou bactérie) ou d'un écosystème et les réponses du vivant à ces contraintes (adaptation, plasticité) de l’échelle moléculaire et cellulaire à celle de l’écosystème. Les notions dispensées en cours sont approfondies en séances de TD par des analyses de résultats et publications scientifiques et mise en relation avec des données réelles produites en séances de TP ou observées lors d'une sortie sur le terrain.

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Cette UE a pour objectif d’acquérir les connaissances de bases en immunologie. L’immunologie est une science qui s’intéresse à la fonction du système immunitaire (SI) qui peut être définie par les mécanismes permettant à un organisme vertébré de faire face aux différents micro-organismes pathogènes (virus, bactéries, champignons), mais également à ses propres cellules devenues tumorales. Le SI doit donc être en mesure d’éliminer les pathogènes et les cellules tumorales et de cohabiter avec la flore non dangereuse (microbiote) et de ne développer aucune réaction adverse vis-à-vis de ses propres cellules non altérées (tolérance). Nous nous attacherons donc à décrire et comprendre comment le SI est capable d’orchestrer des interactions complexes entre :  organes (moelle osseuse, thymus, ganglions lymphatiques…), cellules (cellules dendritiques, lymphocytes B et T, macrophages…) et molécules (anticorps, cytokines…) aux fonctions spécialisées afin de développer une réponse adaptée.

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Cette UE aborde, à travers plusieurs grands modèles de génétique développementale, les mécanismes cellulaires et moléculaires de morphogenèse chez les animaux et les végétaux. Le module présentera les approches classiques et modernes de la recherche en biologie du développement et les techniques et technologies clés qui l'accompagnent. Il se décline en cours magistraux, travaux dirigés sous forme d’analyse de documents (résultats expérimentaux extraits d’articles de recherche) et travaux pratiques pour l’étude multi-approche de transitions développementales.

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Il s'agit d'une introduction à l'écotoxicologie qui est un domaine scientifique faisant appel à l’ensemble des connaissances d’un biologiste-chimiste-écologue afin de comprendre 1) comment les polluants se dispersent et se répartissent dans l’environnement, 2) par quelles voies ils pénètrent dans les organismes, 3) par quels mécanismes ils peuvent impacter les organismes de l’échelle moléculaire à l’échelle individuelle, puis, 4) quelles peuvent être les répercussions de l’échelle populationnelle à l’écosystème. Les étudiants doivent donc intégrer la notion d’échelle spatio-temporelle des évènements écotoxiques (niveau d’organisation biologique et temps au bout duquel l’effet est observé) mais aussi être capable de proposer un scénario de dispersion des polluants à partir de leurs caractéristiques physico chimiques. L’UE doit également permettre aux étudiants de décrypter les enjeux environnementaux actuels liés à la pollution.

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Cette UE a pour objectif de décrire les mécanismes évolutifs à l’origine de la biodiversité et les processus structurant la biodiversité actuelle. Elle aborde ainsi les théories de l’évolution et la reconstitution des histoires évolutives (phylogénie), les mécanismes à l’origine de la diversité au sein des espèces (populations, microévolution) et la formation de nouvelles espèces. Les phénomènes macroévolutifs sont également abordés en lien avec la biogéographie et la diversification des écosystèmes. La dynamique de la biodiversité est étudiée à différentes échelles (populations, communautés, écosystèmes). Enfin, un focus est fait sur les mécanismes évolutifs, écologiques et moléculaires de l'évolution des microorganismes.

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Il s’agit ici de comprendre le fonctionnement du système nerveux principalement au niveau cellulaire. L'objectif de l’UE est de donner aux étudiants un aperçu des bases moléculaires et cellulaires du développement et du fonctionnement normal et pathologique du système nerveux. Sont rassemblées les connaissances de base de l’organisation et du fonctionnement du système nerveux du niveau cellulaire ou même moléculaire au niveau le plus intégré. Dans ce cadre, nous introduirons les mécanismes qui permettent la mise en place de la circuiterie au cours du développement et comment des modifications du fonctionnement synaptique pourraient expliquer certains aspects de la mémoire et des comportements. Enfin le cas de la maladie d'Alzheimer sera utilisé comme exemple d'une pathologie synaptique. Les notions abordées en CM sont approfondies en TD par des exercices d'applications et présentations d’articles scientifiques.

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Ce module correspond à la réalisation d’un stage niveau technicien de 3 semaines. L'objectif est d'acquérir une première expérience technique, de s'intégrer dans un environnement professionnel et de pratiquer les enseignements théoriques dispensés en Licence, particulièrement ceux exposés dans le cadre de PEP3 (Projet d’Exploration Professionnelle).

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Vous trouverez les informations concernant les enseignements transversaux à choix a cette adresse

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Cette UE s’intègre dans le dispositif national « Partenaires scientifiques pour la classe » dont l’objectif est d’épauler un enseignant d’école primaire (Professeur des Écoles, PE) dans la mise en place d’un enseignement des sciences fondé sur la démarche d’investigation. Pour cela, les étudiants (seuls ou en binômes, au choix) accompagnent un PE dans la conception de 5 à 7 séances de sciences puis participent à l’animation de celles-ci , en classe avec le PE.

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Il s'agit d'une UE visant à l'acquisition d'une bonne connaissance du fonctionnement des cellules eucaryotes à travers l’étude de la structure du génome (chromatine), de l’expression génétique (transcription, traduction, maturation et adressage des protéines), du cycle cellulaire (réplication, mitose) et de l’interaction cellule-environnement (signalisation intra cellulaire). Cette UE aborde aussi les premières étapes du développement d’organismes modèles (de la fécondation à la neurulation). L’acquisition de ces connaissances est travaillée en séance de TD à travers des études de documents scientifiques variés issus d’expériences historiques et plus récentes, permettant d’aborder différentes techniques de biologie cellulaire (immunofluorescence, hybridation in situ, Northern Blot, pulse chase, PCR).  En TP, l'étudiant aura une première initiation aux approches expérimentales de culture cellulaire, de fractionnement cellulaire par centrifugation différentielle, et de western blot.

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Il s'agit d'une UE d'introduction aux notions de génétique chez les cellules procaryote et eucaryote ainsi qu'en génétique des populations. En particulier, elle traite des différents mécanismes de transfert horizontal de gènes chez les bactéries et leur utilisation pour la cartographie génétique. Elle traite aussi des différents types d'hybridisme mendélien et non mendélien chez les organismes eucaryotes et décrit des exemples en génétique humaine. Enfin, elle introduit les concepts de base en génétique des populations (principe d’Hardy-Weinberg, régime de reproduction et forces évolutives).

L'acquisition de ces connaissances sera travaillée en TD par des exercices d'application et les séances de TP permettront aux étudiants de se familiariser avec les techniques de bases en génétique bactérienne (transformation, sélection, carte de restriction).

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Il s'agit d'une UE visant à l'acquisition des bases de statistique descriptive et inférentielle. Elle traitera en particulier des méthodes d'estimation ponctuelle, d'estimation par intervalle de confiance, et de tests d'hypothèses dans un cadre paramétrique. Les enseignements sous forme de cours/TD sont complétés par des séances de travaux pratiques sur ordinateur visant à se familiariser avec la manipulation du logiciel R pour la statistique.

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Cette UE vise l'acquisition de connaissance de bases des processus magmatiques et des roches associées. Elle traite en particulier de la nomenclature et de la classification des roches magmatiques, des processus fondamentaux du magmatisme et des grandes séries magmatiques dans leur contexte géodynamique (dorsale océanique, point chaud, rifting continental, subduction). Les séances de TD consistent en des exercices d'application, des analyses de résultats expérimentaux et des études de documents graphiques. En séance de TP, les étudiants sont amenés à étudier des roches magmatiques au microscope optique polarisant et une sortie géologique leur permettra d'observer et d'analyser un affleurement géologique sur le terrain.

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Cette UE concerne les 2 modes de communication dans l'organisme des Mammifères que sont la communication nerveuse et la communication hormonale. Elle vise à faire comprendre la nécessité des régulations physiologiques pour maintenir l’homéostasie de l’organisme, à acquérir les notions de boucle de régulation et d'intégration de signaux de communication. Elle décrit en particulier le rôle de ces processus dans la thermorégulation.

Les notions dispensées en cours sont approfondies en TD sous forme d'exercices d'application ainsi que par l'analyse et la modélisation de données expérimentales.

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Il s'agit d'une UE visant l'acquisition des bases de l'enzymologie (catalyse, équation de Michaelis-Menten, mécanismes de catalyse) et du métabolisme (glycolyse, cycle de Krebbs, métabolisme bactérien).

Les séances de TD consistent en des exercices d'applications des notions vues en cours et en la préparation des séances de TP. Les séances de TP concernent l'apprentissage de la manipulation et de la caractérisation des enzymes (purification, spectroscopie).

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Il s'agit d'une UE visant à la compréhension des concepts généraux et fondamentaux de l'écologie. Elle concerne en particulier les différents niveaux d'intégration en écologie (population, communauté, écosystème, biosphère), l'écologie des populations (dynamique des populations), des communautés (filtres historiques, biotiques et abiotiques et composition des communautés) et des écosystèmes (grands cycles biogéochimiques, écotoxicologie).

Les notions abordées sont approfondies en TD par des exercices d'applications et des analyses de résultats expérimentaux et en séance de TP dont une consiste en une sortie terrain.

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Cette UE aborde la physiologie des mammifères et des plantes. En physiologie végétale, elle concerne la nutrition hydrominérale et carbonée des plantes, ainsi que les aspects de croissance et de développement (développement végétatif et reproducteur). La partie physiologie des mammifères traite du développement, de l'anatomie fonctionnelle et de la physiologie du système nerveux central ainsi que de la motricité somatique chez les mammifères. Les séances de TD consistent en des exercices d'application, des analyses de résultats expérimentaux et un travail de synthèse des notions abordées en cours par la modélisation sous forme de schémas récapitulatifs. En séance de TP, les étudiants sont amenés à réaliser des dissections et des observations d'organismes animaux et végétaux, des mesures d’activité mécanique d’un muscle et des analyses biochimiques du processus photosynthétique.

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Cette UE est une initiation à l'Éthologie. Les CM aborderont les différentes démarches et méthodes d'exploration du comportement animal ainsi que les notions de territoire et de migrations, de sélection sexuelle et de régimes d'appariement, d'organisation des sociétés animales et enfin les propriétés de mimétisme et de camouflage. Les séances de TP concernent la reconnaissance et les méthodes d'analyse des chants d'oiseaux, l'histologie des structures sensorielles, la reproduction des insectes et l'étude de la vie d'une ruche d'abeilles.

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Cette UE concerne l'histoire de la vie à la surface de la planète Terre. Elle traite de paléontologie (origine de la vie, formes de vie et ères géologiques, 5 grandes crises biologique), de radiochronologie et de stratigraphie. Les notions abordées en cours sont approfondies en TD par des exercices d'application et mises en œuvre lors des séances de TP (identification de fossile, anatomie comparée) et lors d'une sortie terrain (cartographie, lecture géologique d'un paysage).

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A travers les nombreux exemples d’animaux vus en cours ou en travaux pratiques, les fonctions de nutrition sont détaillées à différentes échelles, de la cellule à l’organisme, avec une dimension évolutive. Les stratégies alimentaires sont vues sous l’angle de l’écologie fonctionnelle (filtration, phytophagie, prédation, parasitisme). La respiration est également déclinée selon les adaptations anatomiques et physiologiques (poumon, branchie, trachée). Une vision synthétique de l’excrétion azotée termine le cours.

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Cette UE vise l'acquisition de connaissance concernant les aspects moléculaires de la cellule eucaryote. Elle traite en particulier des éléments, des propriétés et du rôle du cytosquelette, des constituants de la matrice extracellulaire, des acteurs de l'adhérence cellulaire, du contrôle du cycle cellulaire en lien avec les cellules cancéreuses et des principes de bases de la différenciation cellulaire. Les notions abordées en cours sont détaillées et approfondies en séances de TD par des exercices d'analyses de résultats expérimentaux. En TP, les étudiants réalisent de la culture cellulaire, mettent en œuvre des expériences d'immunofluorescence et utilisent un microscope photonique pour des analyses histologiques.

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Cette UE vise à l'acquisition de connaissances quant à l'origine et l'évolution du règne végétal à la surface de la planète Terre. Elle traite en particulier de la biologie, de la diversité et de l'évolution des algues, des premières plantes terrestres, des ptéridophytes et des spermaphytes. Enfin la dernière partie du cours concerne la cellule fongique et le règne des champignons. Les étudiants sont amenés à préparer et présenter des exposés oraux lors des séances de TD. En TP, ils utilisent des microscopes avec caméra numérique associée à des logiciels de traitement d’image pour observer des organismes végétaux, la plupart récoltés dans la nature.

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Cette UE a pour objectif de comprendre 1) les processus fondamentaux du métamorphisme et 2) l’utilisation des outils géochimiques dans les phénomènes endogènes. Pour cela, seront étudiées les bases thermodynamiques des réactions métamorphiques, la nature des minéraux index du métamorphisme, les structures des roches métamorphiques et les différents contextes géodynamiques. L’étude du comportement des éléments chimiques majeurs, en trace, et isotopiques dans les processus magmatiques permettra de modéliser les grands processus de fusion partielle, cristallisation fractionnée, contamination et hybridation magmatique dans les différents contextes géodynamiques. Les signatures isotopiques des principaux magmas terrestres seront exploitées pour mettre en évidence les principaux réservoirs mantelliques.

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Cette UE vise l'acquisition de la connaissance des concepts en biologie de l'évolution. Après une introduction concernant l'historique de ces concepts, elle traite de l'évolution biologique et culturelle de la lignée humaine, de génétique des populations (modèle de Hardy-Weinberg, dynamique de la diversité génétique au sein des espèces) et de systématique phylogénétique (principe de la classification phylogénétique, méthode de construction, lecture et interprétation des phylogénies). Les notions vues en cours sont approfondies en séances de TD (biométrie et la lignée humaine, exercice d'applications en génétique des populations, méthodes de construction de phylogénies) et mise en œuvre en TP (comparaison Grands singes et Homme, identification des outils et des chaines opératoires du Paléolithique, simulation d’évolution de fréquences allélique avec le logiciel Populus).

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Cette UE est dédiée à l'apprentissage de l'utilisation des outils de cartographie en géosciences. Les enseignements sont réalisés sous forme de TP durant lesquels les étudiants se familiarisent avec les techniques d’étude des cartes géologiques, à différentes échelles et sur plusieurs régions en France et travaillent à la reconstitution de quelques épisodes de l’histoire géologique de la France.

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Cette UE de physiologie apporte des connaissances sur les fonctions vitales de l’organisme. Elle décrit l’organisation anatomique et fonctionnelle des systèmes, cardiovasculaire, respiratoire et digestif, et explique comment leur coopération et leur coordination par les systèmes nerveux et endocrinien assurent le maintien de l’homéostasie au sein de l’individu. L’approche jusqu’à l’échelle de la cellule, permet de décrire les mécanismes sous-jacents et l’intégration au niveau de l’organisme entier est illustrée par plusieurs exemples. En TP il s'agit notamment de comprendre comment les systèmes respiratoire et cardiovasculaire adaptent leur fonctionnement à la demande énergétique accrue lors de l’exercice physique, chez l’Homme. Cette UE, est aussi l’occasion de se familiariser avec l’expérimentation animale chez le rat, par une étude, sur organe isolé, mettant en évidence l’effet des neuromédiateurs sur la contraction de l’intestin, et par l’étude, sur animal anesthésié, de la régulation de la glycémie. Enfin des exemples physiopathologiques sont donnés en cours afin de mettre l’accent sur les aspects en lien avec la santé.

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Cette UE traite de la géodynamique interne (outils géochimiques, lithosphère océanique, magmatisme, panache mantellique, granitoïdes) et externe (énergie solaire) ainsi que que de tectonique et de géologie structurale (méthodes gravimétrique et sismologique, magnétostratigraphie, structure et tectonique des rifts et zone de subduction, collision continentale). Les notions et méthodes abordées en cours sont approfondies et détaillées lors des séances de TD.

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Cette UE a pour objectif la présentation des milieux de sédimentation depuis la source (Continental) à la plaine abyssale (Marin) ainsi que la dynamique des écoulements responsables de la mise en place de ces environnements sédimentaires. En cours magistral, les enseignements présentent les différents types de milieux sédimentaires (continental, domaine de transition, plateformes clastique et carbonatée, talus, bassins) et les processus physico-bio-chimiques impliqués dans la transformation des sédiments meubles en roche (diagenèse) avec un rappel sur les descriptions des roches sédimentaires (caractères structuraux, minéralogiques et chimiques) et des mécanismes géo-chimiques qui affectent leur formation. Lors des séances de travaux pratiques, les étudiants réalisent des observations en microscopie optique et sont amenés à caractériser, à identifier et à classer les roches sédimentaires clastiques et carbonatées, ainsi qu'à reconnaitre le paléoenvironnement de dépôt.

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Le programme de cette UE vise essentiellement la nécessité de prendre en compte les gésociences fondamentales et appliquées dans une société confrontée aux enjeux de l’approvisionnement en ressources naturelles et à la gestion des risques géologiques. Cela implique de mettre en place les outils et concepts constituant le cadre d’étude de la géologie appliquée = comprendre la formation des ressources naturelles exploitables par l’Homme, les outils de prospection de ces ressources naturelles et les impacts environnementaux de leur exploitation. Comprendre la formation et la dynamique des bassins sédimentaires, en lien avec la formation de potentiels gisements de ressources énergétiques ou minérales. Comprendre la notion de risque naturel en lien avec la géodynamique interne et externe, connaître les modalités de prévention et de prévision de ces risques.

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Le cours d'anglais en L3 s'appuie sur le travail d'initiation aux bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, écrire un résumé, écrire une introduction compte rendu de TP) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

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Il s'agit d'une UE qui comporte 2 thématiques : la physiologie de la reproduction humaine (20h) et l’immunologie (modèle Mammifères essentiellement) (30h). Les thématiques enseignées concernent le fonctionnement des systèmes reproducteurs masculin et féminin ainsi que leurs contrôles par le complexe hypothalamo-hypophysaire (axes gonadotropes), la gestation et la parturition chez la femme ainsi que la fonction de lactation, les méthodes de maîtrise positive et négative de la procréation. Concernant l'immunologie, les enseignements traitent de l'organisation fonctionnelle du système immunitaire humain, des mécanismes cellulaires et moléculaires d’immunité innée et adaptative (à médiation cellulaire et à médiation par les anticorps) à partir d’exemples d’infections bactériennes ou virales. Ils traitent aussi le principe de la vaccination et la diversité des vaccins. Les séances de travaux dirigées permettent de travailler, en plus de l’acquisition de connaissances, des compétences transversales : analyse et exploitation de documents scientifiques, élaboration de schémas de synthèse, communication scientifique écrite. Les séances de travaux pratiques (étude histologique et exposé oral préparé en équipe) permettent une formation à la communication écrite et orale, au travail en équipe, à l’acquisition d’images et à leur exploitation dans un cadre fixé.

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Stage de 5 journées de géologie de terrain avec hébergement.

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Cette UE s’intègre dans le dispositif national « Partenaires scientifiques pour la classe » dont l’objectif est d’épauler un enseignant d’école primaire (Professeur des Écoles, PE) dans la mise en place d’un enseignement des sciences fondé sur la démarche d’investigation. Pour cela, les étudiants (seuls ou en binômes, au choix) accompagnent un PE dans la conception de 5 à 7 séances de sciences puis participent à l’animation de celles-ci , en classe avec le PE.

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Ce module correspond à la réalisation d’un stage niveau technicien de 3 semaines. L'objectif est d'acquérir une première expérience technique, de s'intégrer dans un environnement professionnel et de pratiquer les enseignements théoriques dispensés en Licence, particulièrement ceux exposés dans le cadre de PEP3 (Projet d’Exploration Professionnelle).

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Axé sur la pratique, les étudiants apprendront à utiliser le logiciel libre QuantumGIS et mettront en œuvre les notions acquises sur les SIG vecteurs et rasters pendant le cours. Le cours est articulé autour d’exemples concrets et d’exercices ayant trait aux thématiques des différents parcours de la Licence 3.

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Un premier volet aborde les espaces équatoriaux humides, en discriminant les grands ensembles forestiers américains, africains et asiatiques, leurs origines, leurs contraintes bio-géophysiques ainsi que leur rôle dans les mécanismes d’échelle régionale, synoptique ou planétaire. La suite du cours détaille les causes et conséquences de la déforestation de ces forêts tropicales humides, en s’appuyant à la fois sur des études in situ et géohistoriques, mais aussi sur la surveillance environnementale par télédétection. Une analyse de l’évolution des ressources provenant des forêts équatoriales et des risques socio-environnementaux associés est également menée.      
Un second volet du cours analyse les espaces tropicaux secs, en rappelant leur origines et localisation, ainsi que les mécanismes climatiques à l’origine. Une typologie des climats régionaux est présentée, ainsi que des conditions et contraintes hydrologiques et géomorphologiques, qui définissent ces écosystèmes secs. Plusieurs exemples régionaux sont ensuite étudiés pour définir la gestion des ressources, en décrivant les mécanismes à la fois naturels mais aussi en lien avec les aménagements anthropiques, notamment à l’échelle saharienne mais également à partir d’autres cas spécifiques.
Un troisième volet présente les risques sanitaires dans les Suds en lien avec la variabilité hydroclimatique (pathologies hydriques) ou les extrêmes thermiques (vagues de chaleur), et en analysant des exemples régionaux en Amérique du Sud, en Asie et en Afrique. Un objectif est d’étudier l’origine, la gestion et les impacts de ces épisodes.

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Cette UE apporte les bases de la télédétection pour la cartographie d’occupation et d’usage des sols appliquée à différents milieux. Les traitement sont réalisés sur un logiciel dédié et différentes données satellites sont mobilisées au cours du TP

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L’objectif du cours est de mettre en cohérence et en relation les notions de climatologie, d’hydrologie, de géomorphologie et de biogéographie dans une optique systémique, appliquée aux milieux de montagne, et articulée autour des concepts de géosystème, d’orocomplexe et de zone critique. Il aborde la dynamique des processus en montagne, les relations processus-végétation, les étagements  morphoclimatiques et bioclimatiques, ainsi que les notions d’équilibre et de crise.

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Pour l'option biogéographie il est proposé  de comprendre la dynamique paysagère à l'aide d'observations et de mesures de terrain. La méthode de travail est fondée à la fois sur l'approche historique mais également sur des observations naturalistes. L’option cartographie géomorphologique utilise l’outil de la cartographie géomorphologique pour le relevé détaillé des formes de terrain et comme support à l’interprétation du relief et des dynamiques superficielles. L’atelier se passe en montagne au cours d’un atelier de trois jours sur le terrain.

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L'objectif de cette UE est d'introduire les principes de modélisation formelle (mathématique, statistique et informatique) pour répondre à des questions biologiques et les outils permettant l'analyse des séquences biologiques. Il s'agit en particulier d'apprendre à modéliser les phénomènes biologiques, à tester des hypothèses à l’aide des outils statistiques et bio-informatiques. Les notions abordées en cours sont mises en oeuvre lors des séances TP sur ordinateur avec le logiciel de statistique R et les outils usuels de bio-informatique.

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Cette UE vise à l'acquisition de connaissances quant à l'origine et l'évolution du règne végétal à la surface de la planète Terre. Elle traite en particulier de la biologie, de la diversité et de l'évolution des algues, des premières plantes terrestres, des ptéridophytes et des spermaphytes. Enfin la dernière partie du cours concerne la cellule fongique et le règne des champignons. Les étudiants sont amenés à préparer et présenter des exposés oraux lors des séances de TD. En TP, ils utilisent des microscopes avec caméra numérique associée à des logiciels de traitement d’image pour observer des organismes végétaux, la plupart récoltés dans la nature.

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Le cours d'anglais en L3 s'appuie sur le travail d'initiation aux bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2 à l'UGA ou en IUT. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, écrire un résumé, écrire une introduction compte rendu de TP) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

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Cette UE traite des interactions entre les organismes et leur environnement à différents niveaux d’organisation fonctionnelle à partir d'exemples concernant les différents règnes du vivant et différents environnements contraints. Elle concerne en particulier les biomes et leurs contraintes (à travers l'exemple des biomes arctico-alpin, méditerranéen et désertique), les impacts de ces contraintes sur le fonctionnement d'un organisme (plante ou bactérie) ou d'un écosystème et les réponses du vivant à ces contraintes (adaptation, plasticité) de l’échelle moléculaire et cellulaire à celle de l’écosystème. Les notions dispensées en cours sont approfondies en séances de TD par des analyses de résultats et publications scientifiques et mise en relation avec des données réelles produites en séances de TP ou observées lors d'une sortie sur le terrain.

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Cette UE a pour objectif de décrire les mécanismes évolutifs à l’origine de la biodiversité et les processus structurant la biodiversité actuelle. Elle aborde ainsi les théories de l’évolution et la reconstitution des histoires évolutives (phylogénie), les mécanismes à l’origine de la diversité au sein des espèces (populations, microévolution) et la formation de nouvelles espèces. Les phénomènes macroévolutifs sont également abordés en lien avec la biogéographie et la diversification des écosystèmes. La dynamique de la biodiversité est étudiée à différentes échelles (populations, communautés, écosystèmes). Enfin, un focus est fait sur les mécanismes évolutifs, écologiques et moléculaires de l'évolution des microorganismes.

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Ce module correspond à la réalisation d’un stage niveau technicien de 3 semaines. L'objectif est d'acquérir une première expérience technique, de s'intégrer dans un environnement professionnel et de pratiquer les enseignements théoriques dispensés en Licence, particulièrement ceux exposés dans le cadre de PEP3 (Projet d’Exploration Professionnelle).

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Il s'agit d'une introduction à l'écotoxicologie qui est un domaine scientifique faisant appel à l’ensemble des connaissances d’un biologiste-chimiste-écologue afin de comprendre 1) comment les polluants se dispersent et se répartissent dans l’environnement, 2) par quelles voies ils pénètrent dans les organismes, 3) par quels mécanismes ils peuvent impacter les organismes de l’échelle moléculaire à l’échelle individuelle, puis, 4) quelles peuvent être les répercussions de l’échelle populationnelle à l’écosystème. Les étudiants doivent donc intégrer la notion d’échelle spatio-temporelle des évènements écotoxiques (niveau d’organisation biologique et temps au bout duquel l’effet est observé) mais aussi être capable de proposer un scénario de dispersion des polluants à partir de leurs caractéristiques physico chimiques. L’UE doit également permettre aux étudiants de décrypter les enjeux environnementaux actuels liés à la pollution.

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Cette UE aborde les principales causes régissant la variabilité océano-atmosphérique globale, via deux approches complémentaires : l’observation et la modélisation climatique. Ces bases permettent de voir comment les projections du climat sont construites, d’en déterminer leur part d’incertitude, et de comprendre en quoi elles répondent à différentes utilisations environnementales et sociétales.

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