UE Modélisation en Biologie - BIO504

L'objectif de cette UE est d'introduire les principes de modélisation formelle (mathématique, statistique et informatique) pour répondre à des questions biologiques et les outils permettant l'analyse des séquences biologiques. Il s'agit en particulier d'apprendre à modéliser les phénomènes biologiques, à tester des hypothèses à l’aide des outils statistiques et bio-informatiques. Les notions abordées en cours sont mises en oeuvre lors des séances TP sur ordinateur avec le logiciel de statistique R et les outils usuels de bio-informatique.

Connaissances de base en statistiques (voir STA301)

Connaissances générales en Biologie de niveau L2

Connaissances de l'organisation d'un gène et du génome.

• Savoir choisir un test statistique
• Savoir interpréter les résultats d'un test statistique
• Savoir utiliser le logiciel de statistiques R
• Aborder les problèmes liés à l’utilisation des techniques informatiques dans les approches de recherche en biologie.
• Comprendre l’usage des bases de données généralistes
• Aborder les techniques d’alignement de séquences
• Comprendre les notions de recherche de similitudes de type BLAST