Parcours Technologies du vivant 3e année

Il s'agit d'une UE principalement expérimentale dont l'objectif est la formation des étudiants aux techniques actuelles utilisées couramment dans les domaines de la biochimie, de la biologie moléculaire, de la biologie cellulaire et de l'immunologie. Les séances de TP se déroulent dans des conditions (matériel, durée d'expérimentation) comparables à l'activité en laboratoire de biologie. Elles sont précédées et suivies par des séances de TD visant à accompagner les étudiants dans l'appréhension des protocoles techniques, dans la mise en forme et l'analyse de résultats expérimentaux.

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L'objectif de cette UE est la compréhension des processus cellulaires au niveau moléculaire détaillé. Il s'agit notamment d'étudier par le détail les structures des protéines, des acides nucléiques ainsi que les relations structure-fonction des biomolécules, la formation des complexes et les réactions chimiques impliquées dans certains processus eucaryotes. Les principales questions abordées sont (1) le monde de l'ARN : transcription et traduction, ARN non-codant, ARN enzymatique, dégradation des ARNs non-sens (2) les modifications post-traductionnelles comme la glycosylation, le rôle de l'ubiquitine, la phosphorylation (3) les mécanismes de transduction des signaux (4) les principes de conversion d'énergie et (5) l'enzymologie générale. Les TD complètent les cours et approfondissent tous les sujets traités en cours.

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Le cours d'anglais en L3 s'appuie sur le travail d'initiation aux bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2 à l'UGA ou en IUT. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, écrire un résumé, écrire une introduction compte rendu de TP) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

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L'objectif de cette UE est de préparer l'étudiant à l’insertion professionnelle. Elle accompagne un travail personnel de l'étudiant visant à  mieux se connaître pour mieux savoir communiquer, à mieux connaître le monde professionnel pour identifier les attendus et à savoir synthétiser ces différents aspects en vue d'un entretien d'embauche.

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Étude de fonction d'une variable.

Développements limités de fonctions d’une variable et interprétation graphique.

Fonctions de plusieurs variables : points critiques,  gradient, Laplacien.

Introduction aux fonctions vectorielles et opérateurs différentiels : divergence, rotationnel.

Intégrales : signification et applications physiques.

Equations différentielles : résolution de différentes équations du premier ordre, du deuxième ordre à coefficients constants ; interprétation d’une équation différentielle.

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Travaux Pratiques :

Les travaux pratiques de cette UE ont pour but de former les étudiants aux techniques couramment utilisées dans les domaines de la biochimie et de la biophysique. Les enseignements dispensés s’articulent autour d’une protéine fluorescente modèle, la Cerulean. A travers un enchainement de 3 séances, cette protéine sera purifiée, caractérisée biochimiquement mais aussi par spectroscopie (UV-visible et fluorescence), cristallisée et étudiée in-silico. Les étudiants se familiariseront à la manipulation de cristaux et ils pourront voir les rudiments d’une collecte de donnée sur un synchrotron grâce au support de la ligne de lumière française FIP localisée à l’ESRF. La structure tridimensionnelle de la Cerulean sera alors analysée et les résultats biochimiques et spectroscopiques seront interprétés à l’aune des observations effectuées sur le modèle PDB idoine. Une comparaison avec la GFP permettra d’ouvrir la réflexion sur les évolutions passées et mise en œuvre par génie génétique.

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L’UE « Stage » représente un aspect essentiel du parcours Technologies du vivant, en offrant aux étudiants une première expérience professionnelle concrète dans le domaine des biotechnologies, et plus spécifiquement de la bioproduction.

Ce stage de 4 mois (Février à Mai) s’effectue au sein d’un laboratoire, qu’il appartienne au secteur privé (industrie pharmaceutique, biotechnologique, agroalimentaire, etc.) ou au secteur académique (laboratoires universitaires, instituts de recherche publics). Il s’inscrit dans une logique d’application des connaissances théoriques et pratiques acquises tout au long de la formation, en plaçant l’étudiant au cœur d’un environnement scientifique et technique réel. L’objectif principal de cette UE est double : d’une part, permettre à l’étudiant de valoriser ses compétences – en bioprocédés, en analyse expérimentale, en maîtrise des outils de laboratoire – dans un contexte professionnel exigeant ; d’autre part lui faire découvrir l’organisation, les enjeux et les contraintes du travail en recherche et développement. À travers cette immersion, l’étudiant est amené à participer activement à un projet expérimental, à intégrer une équipe, à respecter les normes en vigueur (qualité, sécurité, réglementation) et à développer des compétences transversales telles que la gestion du temps, la communication scientifique, l’adaptabilité ou encore le travail collaboratif. Enfin, ce stage constitue une opportunité de réflexion sur son projet professionnel, en aidant l’étudiant à mieux cerner ses aspirations, à identifier les débouchés possibles dans le secteur des biotechnologies, et à renforcer son employabilité à l’issue de la formation.

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Cette UE vise à initier les étudiants aux concepts de base indispensables pour évaluer les performances et dimensionner les réacteurs chimiques homogènes isothermes. En fin de programme, l’ouverture sur les bioréacteurs a pour objectif de sensibiliser les étudiants aux spécificités associées aux bioprocédés réactifs. Les enseignements sont dispensés sous forme de cours/TD associés à 3 séances de Travaux Pratiques.

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Cette UE concerne les concepts de la production des protéines recombinantes dans divers systèmes d’expression (bactériens, eucaryotes), les méthodes adaptées à la purification et à l'analyse structure/fonction de ces protéines, ainsi que les domaines d’application de ces méthodologies. A l'issue de ce module, les étudiants auront acquis les connaissances permettant de proposer une stratégie de production d’une protéine, en fonction de ses caractéristiques et de son domaine d’utilisation. En TP, l’étudiant aura une initiation à la production d’une protéine via l'utilisation de cultures continues en bioréacteurs et de cultures discontinues en Erlen.

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