Diplômes intégrant cet élément pédagogique :
Descriptif
L'objectif de cette UE est d'introduire les principes de modélisation formelle (mathématique, statistique et informatique) pour répondre à des questions biologiques et les outils permettant l'analyse des séquences biologiques. Il s'agit en particulier d'apprendre à modéliser les phénomènes biologiques, à tester des hypothèses à l’aide des outils statistiques et bio-informatiques. Les notions abordées en cours sont mises en oeuvre lors des séances TP sur ordinateur avec le logiciel de statistique R et les outils usuels de bio-informatique.
Pré-requis recommandés
Connaissances de base en statistiques (voir STA301)
Connaissances générales en Biologie de niveau L2
Connaissances de l'organisation d'un gène et du génome.
Compétences visées
- Savoir choisir un test statistique
- Savoir interpréter les résultats d'un test statistique
- Savoir utiliser le logiciel de statistiques R
- Aborder les problèmes liés à l’utilisation des techniques informatiques dans les approches de recherche en biologie.
- Comprendre l’usage des bases de données généralistes
- Aborder les techniques d’alignement de séquences
- Comprendre les notions de recherche de similitudes de type BLAST
Informations complémentaires
Lieu(x) : GrenobleLangue(s) : Français
En bref
Période : Semestre 5Crédits : 6
Volume horaire
- CM : 22.5h
- TP : 27h
Contact(s)
Eric Coissac