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    UE Modélisation en Biologie - BIO504

    • Niveau d'étude

      Bac +3

    • ECTS

      6 crédits

    • Composante

      UFR Chimie-Biologie

    • Période de l'année

      Toute l'année

    Description

    L'objectif de cette UE est d'introduire les principes de modélisation formelle (mathématique, statistique et informatique) pour répondre à des questions biologiques et les outils permettant l'analyse des séquences biologiques. Il s'agit en particulier d'apprendre à modéliser les phénomènes biologiques, à tester des hypothèses à l’aide des outils statistiques et bio-informatiques. Les notions abordées en cours sont mises en oeuvre lors des séances TP sur ordinateur avec le logiciel de statistique R et les outils usuels de bio-informatique.

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    Heures d'enseignement

    • UE Modélisation en Biologie - CMCM22,5h
    • UE Modélisation en Biologie - TPTP27h

    Pré-requis recommandés

    Connaissances de base en statistiques (voir STA301)

    Connaissances générales en Biologie de niveau L2

    Connaissances de l'organisation d'un gène et du génome.

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    Période

    Semestre 5

    Compétences visées

    • Savoir choisir un test statistique
    • Savoir interpréter les résultats d'un test statistique
    • Savoir utiliser le logiciel de statistiques R
    • Aborder les problèmes liés à l’utilisation des techniques informatiques dans les approches de recherche en biologie.
    • Comprendre l’usage des bases de données généralistes
    • Aborder les techniques d’alignement de séquences
    • Comprendre les notions de recherche de similitudes de type BLAST
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