Ingénieur de Polytech Grenoble spécialité Technologies de l'information pour la santé

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- Renforcement des acquis du B1 dans le but d’atteindre le niveau B2
- Introduction au discours scientifique
- Développement de vocabulaire scientifique
- Apprentissage de la rédaction et de la structure d’un rapport scientifique
- Ouverture à la communication orale formelle et informelle

1 Expression Orale

1.1 Description d'objets
- La forme, la dimension, la position, les matériaux, l'utilisation
- Causes et conséquences

1.2 Techniques de présentation orale
- Structuration,  Introduction, Liens, Présenter de l'information visuelle, Conclusion

1.3 Prononciation
- Connaissance et pratique des phonèmes anglais
- Connaissance et pratique de l'accentuation
- Prononciation de chiffres, de lettres et de symboles mathématiques

  2 Expression écrite

2.1 Rédaction de texte descriptif
- Utilisation à l'écrit des fonctions apprises en 1.1

2.2 Rédaction de description de données statistiques

2.3 Rédaction de lettre de candidature
- Utilisation de tournures standard

2.4 Décrire une situation, une expérience présente et passée

2.5 Prise de notes
- Rédaction de synthèse à partir d'un texte écrit ou oral, ou à la suite d'un échange entre apprenants

2.6 Rédaction de mini-rapport scientifique
- En binôme entre deux filières, validé par un jury mixte professeur d'anglais/professeur scientifique

  3 Compréhension orale et écrite :

3.1 Compréhension de descriptions et de présentations décrites en 1.1, 1.2 et 1.3

3.2 Compréhension globale de documents audio et vidéo authentiques

3.3 Compréhension d'échanges d'information en face à  face

3.4 Compréhension détaillée de textes et de documents audio/vidéo de vulgarisation scientifique

- Reinforcing B1 skills in order to reach B2
- Introduction to scientific discourse
- Development of scientific vocabulary
- Learning to write and organise a scientific report
- Introduction to formal and informal communication

  1 Speaking Skills

1.1 Object Description
- Shape, measurement, position, materials, use
- Cause and consequences
- Description of statistical data
- Graph description
- Future hypothesis

 1.2 Presentation techniques
- Structure, Introduction, Signposting, Visuals, Conclusion

1.3 Pronunciation
- Awareness and use of English phonemes
- Awareness and use of stress patterns
- Pronunciation of numbers, letters and mathematical symbols

  2 Writing Skills

2.1 Descriptive texts
- Written use of functions studied in 1.1

2.2 Written description of statistical data

2.3 Cover letter (use of standard forms)

2.4 Describing a present, past situation or experience

2.5 Note-taking
- Summary-writing based on a written or audio document, or following pair or group work

2.6 Writing of short scientific report
- In pairs between two different departments, assessed by a combined panel English teacher/Science teacher

  3 Listening/Reading Comprehension

3.1 Understanding of descriptions/presentations described above.

3.2 Global understanding of authentic audio/video documents

3.3 Understanding of information exchanges face-to-face or on the telephone

3.4 Detailed understanding of scientific texts and audio/video documents

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Acquérir un savoir-faire et une meilleure aisance dans la prise de parole en public : discours structuré et vivant, clair et concis.
Prendre conscience des différents paramètres en jeu dans une prestation orale, notamment de la communication non-verbale.
Gérer ses émotions.

7 séances thématiques: 

- Fondamentaux de la communication relationnelle
- Esprit d'équipe
- Communiquer en groupe
- Valorisation
- Improvisation et sens de la répartie
- Communication non verbale
- Gestion du stress

Acquire know-how and greater fluency in public speaking: structured and lively, clear and concise speech.
Become aware of the different parameters involved in oral performance, especially non-verbal communication.
Manage emotions in front of an audience.

7 thematic session:

- Fundamentals of relational communication
- Team spirit
- Communicate in a group
- Valuation
- Improvisation and sense of repartee
- Non-verbal communication
- Stress management

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Acquérir une culture générale sur les principales problématiques en économie et en droit.

Poser un regard éclairé sur l'actualité économique et sur les rôles et droits du citoyen.

Économie :

- Le circuit économique
- La croissance
- Emploi et chômage

Droit :

- L'ordre judiciaire français
- Les sources du droit
- La personnalité juridique et les droits subjectifs
- Les contrats

Acquire a general knowledge of the main issues in economics and law.

Take an enlightened look at current economic events and the roles and rights of the citizen.

Economics:

- The economic cycle
- Economic growth
- Employment and unemployment

Law :

- The French Judicial system
- Law sources
- Legal personality and subjective rights
- Contracts

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Objectif des mathématiques générales de début d'année : acquérir ou conforter les notions de base en mathématiques : équations différentielles, nombres complexes, intégration, algèbre linéaire.

 MATHÉMATIQUES GÉNÉRALES

1. Analyse

Nombres complexes
Étude de fonctions
Développements limités
Équations différentielles linéaires
Calcul intégral
Intégrales impropres

2. Algèbre linéaire
Opérations élémentaires sur une matrice rectangulaire
Algorithme de Gauss et applications
Inversion d'une matrice et calcul de déterminant
Diagonalisation d'une matrice

The main objective of this course is to acquire or reinforce the basic notions of mathematics: differential equations, complex numbers, integration, linear algebra.

GENERAL MATHEMATICS

1. Analysis

Complex numbers
Study of a function
Taylor expansion
Differential equations
Integrals
Generalized integrals

2. Linear algebra

Basic operations on a rectangular matrix
Gauss algorithm and applications
Inversion of a matrix and calculus of a determinant
Matrices diagonalization

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Acquérir les bases nécessaires à  la structuration et au traitement de données dans l'ingénierie du logiciel.
Le typage, l'organisation et la modélisation des données sont abordés grâce aux technologies XML (XML Schema). Le traitement des données passe par l'apprentissage de l'algorithmique et l'ingénierie logicielle par la programmation orientée objet (langage Java).
Ce cours se veut une introduction aux méthodes de conception et de programmation d'applications et de bibliothèques logicielles. Il s'appuie constamment sur des notions de génie logiciel et de programmation méthodologique.

Partie 1 : Typage (XML/XML Schema)
- Qu'est-ce qu'un langage ? Qu'est-ce qu'une donnée ?
- Structuration des données
- Définition de types de données

Partie 2 : Algorithmique et Programmation Objet (Java)
- Structures algorithmiques, de contrôle et de données
- Notions objet (instance, classe, attributs, encapsulation, méthodes, modularité, généricité, héritage, polymorphisme, interface, classes abstraites)

Acquire minimal knowledge about structuring and processing data in the context of software engineering.

Part 1: Types (XML/XML Schema)
- What's a computer language? What is data?
- Data structures
- Define new data types

Part 2: Algorithm (Java)
- Memory representation
- Algorithmic structures and flow control

Part 3: Object Oriented Programming (Java)
- studied concepts: instance, class, attributes, encapsulating, method, modularity, genericity, inheritance, polymorphism, interface, and abstract class

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Avoir un aperçu de l'anatomie morphologique et fonctionnelle   de l'ensemble des appareils qui composent  le corps humain.

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Acquérir la logique technique permettant de réaliser un examen histologique et les notions de base d'organisation des cellules en tissu complexes.
Comprendre le fonctionnement d'un laboratoire hospitalier du prélèvement tissulaire au diagnostic,  acquérir un vocabulaire permettant de dialoguer et de comprendre les attentes de biologistes.

- Techniques en histologie et anatomie pathologique
- Rappels de biologie de la cellule
- De la cellule au tissu
- Tissu épithélial
- Tissu conjonctif
- Le sang
- Quelques notions sur les tumeurs

- Methods in histology and et pathology
- Cellular biology synopsis
- From cell to tissue
- Epithelial tissue
- Conjonctive tissue
- Blood
- Tissue tumors some notions

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- Savoir dialoguer avec les acteurs de la santé
- Initiation à la recherche clinique et l'investigation clinique
- Réglementations, contraintes et éthiques en santé
- Formation obligatoire de 1er secours, diplôme agréé par le CESU (Centre d'Enseignement des Soin d'Urgence),
- Stage en milieu hospitalier (15jours) avec les soignants.
Découvrir la réalité du fonctionnement d’un service hospitalier, la notion de travail d’équipe, la diversité des métiers de soignant.

Intervenants Médecins, cadre de santé, médecin DIM, de Novembre à  décembre 32h cours magistraux

- Raisonnement médical
- Biologie médical du sport
- Sémiologie médical, Maladie Thromboembolique
- Physiologie de l'Hémostase
- Explorations fonctionnelles vasculaires
- Médecine du sport et traumatologie , biologie médical du sport
- Dépendance, autonomie, immobilisation
- Les escarres
- Gestions des risques: exemples de l'anesthésie
- Maladie thromboembolique , notion de stratégie de diagnostique
- Organisation de la recherche clinique
- Démographie du vieillissement
- Démence trouble du comportement
- Les contraintes et éthiques et réglementaires en santé

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Comprendre l'organisation, le management, le processus de décisions au sein des établissements de santé et particulièrement d'un CHU.
Replacer dans un cadre réglementaire et organisationnel les connaissances qui seront acquises sur le terrain à  l'occasion des stages d'immersion.

PARTIE 1 - INTRODUCTION AU MONDE HOSPITALIER
   1. Les grandes étapes historiques de l’Hôpital
   2. L'organisation de la santé en France
   3. Les missions de l’Hôpital public
PARTIE 2 - L'ORGANISATION D'UN CHU
   1. L'organisation administrative
   2. Les instances consultatives
   3. L'organisation interne des activités
PARTIE 3 - LES FINANCES HOSPITALIÈRES (EPRD)
   1. La tarification à l'activité (T2A)
   2. Le compte de résultat
   3. e bilan et le financement des investissements
PARTIE 4 - LA FONCTION PUBLIQUE HOSPITALIÈRE
   1. Les fonctionnaires et les contractuels hospitaliers
   2. Les droits et les devoirs du fonctionnaire hospitalier
PARTIE 5 - LA QUALITÉ ET L’ACCRÉDITATION DES ÉTABLISSEMENTS DE SANTÉ

PART 1 - INTRODUCTION TO THE HOSPITAL WORLD
   1. The main steps of the constitution of the public hospital
   2. The health organization in France
   3. The missions of a public hospital
PART 2 - THE ORGANIZATION OF A CHU
   1. The administrative organization
   2. The advisory bodies
   3. The internal organization of activities
PART 3 - THE HOSPITAL FINANCES
   1. The pricing
   2. The income statement
   3. The balance sheet and the investment
PART 4 - THE PUBLIC HOSPITAL
   1. The categories of staff
   2. Their rights and duties
PART 5 - THE QUALITY

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Les objectifs sont de :

- Présenter les notions de bases de données et de Systèmes de Gestion de Bases de Données (SGBD).

- Décrire les principes de fonctionnement des SGBD, les fonctions d'administration des bases de données en insistant sur la gestion et la manipulation

Plan :

- Introduction

- Ecriture ensembliste / Sets

- Algèbre relationnelle / Relationnal algebra

- SQL pour manipuler des données / SQL for querying data

- SQL pour définir des données / SQL for managing data

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Modélisation, représentation et traitement des bio-signaux.
Maîtrise des outils théoriques pour la représentation et le filtrage des signaux.

A. Signaux déterministes
   1. Modélisation des signaux : fonctions usuelles
   2. Transformée de Fourier
   3. Corrélation et Densité Spectrale de Puissance
B. Signaux aléatoires
C. Filtrage

A. Deterministic signals
   1. Signal Modelisation : usual functions
   2. Fourier Transform
   3. Correlation et Power Spectral Density
B. Random signals
C. Filtering

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* S'interroger sur la génération de données en physiologie humaine et plus spécifiquement sur la génération de certains signaux physiologiques
* Connaître l'origine, la manière dont on génère et interprète les signaux physiologiques en s'appuyant sur des exemples concrets dans le domaine cardio-respiratoire
* Mettre en pratique le cours théorique par des séances de travaux pratiques et dirigés

Programme :
- 12h de cours théoriques
- 4h de travaux dirigés pour la prise en main du matériel de TP
- 3h de travaux pratiques sur la mesure de pression artérielle et mesure échographique

Plan :
I - Données physiologiques
   1 - Donnée et information
   2 - Contexte industriel et clinique des donnée
II - Origine des signaux physiologiques (illustration cardio-respiratoire)
   1 - Définitions
   2 - Cardiaque
   3 - Respiratoire
   4 - Exemples d'application au sommeil : polysomnographie
III - Mesure des signaux physiologiques (illustration cardio-respiratoire)
   1 - Terminologie de la mesure
   2 - Considérations sur les capteurs et exemples

* To question the generation of data in human physiology and more specifically on the generation of certain physiological signals
* Know the origin, the way we generate and interpret physiological signals based on concrete examples in the field of cardio-respiratory
* Put the theoretical course into practice by practical and directed sessions

Program :
- 12h of theoretical classes
- 4 hours of tutorials for the handling of the construction equipment
- 3 hours of practical work on blood pressure measurement and ultrasound measurement

Outline:
I - Physiological data
   1 - Data and information
   2 - Industrial and clinical context of the data
II - Origin of physiological signals (cardiorespiratory illustration)
   1 - Definitions
   2 - Cardiac
   3 - Respiratory
   4 - Examples of application to the sleep: polysomnography
III - Measurement of physiological signals (cardiorespiratory illustration)
   1 - Terminology of measurement
   2 - Sensor Considerations and Examples

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- Renforcement des compétences B1 pour tendre vers le niveau B2
- Introduction au discours scientifique
- Développement de vocabulaire scientifique
- Rédaction d'un rapport scientifique (introduction à  la recherche)
- Ouverture à  la communication orale formelle et informelle

1. Expression orale

1.1 Exprimer le futur
      - Les différentes formes du futur
      - Exprimer la probabilité et utiliser les modaux
1.2 Description de données statistiques graphiques
      - Causes et conséquences
      - Hypothèses futures
1.3 Techniques de présentation orale
     - Introduction
     - Liens
     - Présenter de l'information visuelle
     - Conclusion
1.4 Prononciation
     - Connaissance et pratique des phonèmes anglais
     - Connaissance et pratique de l'accentuation

2.  Expression Écrite

2.1 Rédaction de texte descriptif
     - Utilisation à  l'écrit des fonctions apprises au S5
     - Rédaction de mini-rapport scientifique
2.2 Rédaction de description de données statistiques
     - Utilisation à  l'écrit des fonctions appris en 1.2
2.3 Prise de notes
    - Rédaction de résumé à  partir d'un texte écrit ou oral, ou à  la suite d'une conversation

3.  Compréhension Orale et écrite :

3.1 Compréhension de descriptions et de présentations décrites en 1.1, 1.2 et 1.3
3.2 Compréhension globale de documents audio et vidéo authentiques
3.3 Compréhension d'échanges d'information en face à  face ou au téléphone
3.4 Compréhension détaillée de textes généraux et de vulgarisation scientifique

- Reinforcing B1 skills in order to reach B2
- Introduction to scientific discourse
- Development of scientific vocabulary
- Learning to write and organise a scientific report
- Introduction to formal and informal communication

1 Oral expression

1.1 Expressing the future
     - Different ways to express the future
     - Expressing probability & using modal verbs
1.2 Describing trends (statistical data / graphs)
     - Causes and consequences
     - Future Hypotheses
1.3 Presentation Skills
     - Introduction
     - Signposting
     - Presenting visual data
     - Conclusion
1.4 Pronunciation
     - Awareness and use of English phonemes
     - Awareness and use of stress patterns

2 Written Production

2.1 Writing a report
     - Using Semester 5 written phrases and skills in order to write a mini scientific report
2.2 Writing about trends
     - Analysing statistics and graphs as learnt in 1.2 in an essay
2.3 Note-taking
     - Writing a summary from notes taken from a written document or an audio document, or a conversation

3. Reading and Listening Comprehension

3.1 Understanding descriptions and presentations as described in 1.1, 1.2 and 1.3
3.2 Global comprehension of authentic audio and video recordings
3.3 Comprehension of exchange of information face to face of by phone
3.4 Detailed comprehension of general and scientific texts

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- Améliorer les compétences rédactionnelles
- Optimiser une prise de notes en vue d'une synthèse
- Élaborer une argumentation avec des outils linguistiques et rhétoriques
- S'initier à  quelques formes de documents professionnels
- Réviser les principales bases de l'orthographe en vue d'une relecture d'un document professionnel

Séance 1 : initiation mindmap ;
Séance 2 : test d'orthographe et corrigé ;
Séance 3 : sensibilisation aux synonymes et application sur mails professionnels ;
Séance 4 : notion de plan et rédaction d'un document type note de service/phase de projet ;
Séance 5 : types d'argumentation et rédaction d'un discours d'entreprise ;
Séance 6 : examen et autoévaluation

- Argumentation with linguistic and rhetorical tools
- Introduction to some forms of professional documents
- Review the main bases of spelling with a view to proofreading a professional document

Session 1: mindmap initiation;
Session 2: spelling test and answers;
Session 3: synonym awareness and application to professional emails;
Session 4: concept of a plan and drafting of a standard document memorandum/project phase;
Session 5: types of argumentation and writing a company speech;
Session 6: examination and self-assessment

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L'objectif du cours est d'acquérir ou consolider des connaissances sur l'entreprise.

L'apprentissage conduira à  une compréhension du fonctionnement général des organisations, une connaissance du langage des managers et des gestionnaires, et une préparation au travail en équipe et à  l'encadrement, à  travers une réflexion sur les pratiques de management.

1. Qu'est-ce que l'entreprise ? Définition, réalité économique et apparence juridique, études de cas
2. Comprendre l'environnement de l'entreprise. Approche orientée business : analyse stratégique ; approche orientée marché : marketing ; approche orientée parties prenantes : RSE
3. L'organisation de l'entreprise. Les structures organisationnelles, le pouvoir, l'exercice du leadership
4. Les ressources mises en œuvre dans l'activité économique. Ressources humaines, matérielles, et financières
5. Le déploiement des activités. La fonction approvisionnement ; la gestion de production
6. La comptabilité financière. Le système d'information comptable, les comptes annuels
7. La comptabilité de gestion. Le seuil de rentabilité, les coûts complets
Simulation de gestion

The objective of the course is to acquire or consolidate knowledge about the firm.

Learning will lead to understand the general functioning of organizations, to know the language of managers, and to be prepared to teamwork and coaching, through a reflection on management practices.

1. What is the firm ? Definition, economic reality and legal appearance, case studies
2. Understand the business environment. Strategic analysis, marketing, stakeholders and CSR
3. The organization of the firm. Organizational structures, power, leadership
4. The resources used in the economic activity. Human, material and financial resources
5. The deployment of activities. The supply function, prduction management
6. Financial accounting. The accounting information system, the annual accounts
7. Management Accounting. The breakeven point, the full costs
Serious business game

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L'analyse de Fourier et les probabilités doivent permettre de manipuler les outils mathématiques indispensables à  d'autres sciences de l'ingénieur : l'analyse de Fourier est indispensable au traitement du signal et à  la résolution des équations aux dérivées partielles, les probabilités aux statistiques et au traitement de données.

ANALYSE de FOURIER
1. Série de Fourier
     - Série de Fourier d'une fonction périodique L2 sur sa période. Théorème de Parseval
     - Série de Fourier d'une fonction périodique L1 sur sa période. Théorème de Dirichlet
2. Transformée de Fourier
     - Premières propriétés de la transformée de Fourier dans L1
     - Théorème d'inversion de la transformée de Fourier dans L1
     - Théorème de Plancherel
     - Convolution et transformée de Fourier

PROBABILITÉS
- Espaces probabilisés
- Probabilité conditionnelle et indépendance
- Généralités sur les variables aléatoires
- Variables aléatoires discrètes
- Variables aléatoires continues
- Fonction caractéristique d'une variable aléatoire
- Théorème limite centrale

Fourier analysis and probabilities allow to manipulate the mathematical tools essential to other engineering sciences: Fourier analysis is essential for signal processing and solving partial differential equations, probabilities for statistics and data processing.

FOURIER ANALYSIS
1. Fourier series
     - Fourier series of a periodic function and Parseval theorem
     - Fourier series of a periodic function and Dirichlet theorem
2. Fourier transform
     - Fourier transform basic properties
     - Fourier transform inversion theorem
     - Plancherel theorem
     - Fourier transform and convolution

PROBABILITY
- Conditional probability and independence
- Discrete random variables
- Continuous
- Random variables
- Characteristic function of a random variable
- Central limit theorem

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Le projet informatique de fin d'année a pour but principal l'intégration des connaissances acquises au cours des différents enseignements informatiques de l'année.
Le projet se fait sous la forme d'un "serious game" dans lequel chaque groupe doit proposer une solution logicielle en réponse à  un appel d'offre d'un hôpital concernant la création d'un dossier patient informatisé.

Une semaine et demi de projet à  plein temps, à  la fin de l'année, découpée en 3 temps :
- découverte et analyse du cahier des charges
- proposition d'une solution chiffrée (en h.pers)
- développement

Une présentation orale (recette) du logiciel clôture le projet.

This project is based on a serious game. Groups of 3 to 4 students create a fictional company to answer a tender process presented by a fictional hospital to build their information systems.

One and a half full-time week, at the end of the year, is staged in three parts:
- analyze of the specification documents
- quantified proposal (in h.pers)
- development

The evaluation is done during an oral presentation and the demo of the resulting software.

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Comprendre et maîtriser les éléments d'architecture logicielle nécessaire à la réalisation de systèmes interactifs.

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Conforter ou acquérir les bases de la biochimie des acides nucléiques. Introduire les techniques modernes de la biologie moléculaire, utilisées en biotechnologie.

« LES MOLÉCULES SUPPORT DE L’HÉRÉDITÉ»
A. Biochimie des acides nucléiques
   I/ Introduction/Vue générale - dogme central
   II/ Composants de base/Structure acides nucléiques
   III/ Réplication, Réparation et Modification du génome
B. De l'ADN vers les protéines
   I/ Transcription
   II/ La traduction
C. Les outils de génétique moléculaire
D. Introduction à  la génomique et génotypage

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Comprendre les principales fonctions du corps humain, approche de la physiologie sous forme de systèmes: définition des éléments du système, échanges entre ces éléments, échanges avec d'autres systèmes et/ou le milieux extérieur

Compétences visées : Maîtriser le vocabulaire associé aux principales fonctions du corps humain dans la perspective d'une communication efficace avec les professionnels du monde de la santé.

1) Physiologie Respiratoire
2) Propriétés électriques des membranes excitables
3) Neurophysiologie
4) Système nerveux autonome

Understand the main functions of the human body, approach to physiology in the form of systems: definition of system elements, exchanges between these elements, exchanges with other systems and / or the external environment

Skills targeted: Master the vocabulary associated with the main functions of the human body in the perspective of effective communication with medical professionals.

1) Respiratory Physiology
2) Electrical properties of excitable membranes
3) Neurophysiology
4) Autonomic nervous system

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Objectifs : Ce stage de première année d'école d'ingénieur (mais troisième année du cursus universitaire) est centré sur la découverte du monde des soignants  dans les unités de soins et est analogue au stage des étudiants en deuxième année de médecine. Les unités de soins accueillant des patients concernées sont: médecine, chirurgie et obstétrique.

Compétences visées : Connaissance des métiers de la santé centrée sur les soignants, faire découvrir la réalité du fonctionnement d'un service hospitalier, la notion de travail d'équipe, la diversité des métiers de soignant. La prise en compte de la dimension humaine de la Santé est un objectif majeur de ce stage.

> Stage (pas de cours)

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Présentation des concepts, modèles et techniques nécessaires à  la conception de systèmes interactifs utiles et utilisables.
Compétences : Maîtrise des fondements conceptuels de l'interaction homme-machine. Connaissance des notations et modèles de référence en Interaction Homme-Machine.
Savoir-faire : Conception d'interfaces homme-machine : de l'analyse des besoins centrée utilisateur à  la conception de l'interaction homme-machine.

(1)    Historique du domaine de l'Interaction homme-machine
(2)    Paradigme d'interaction : virtualité / réalité augmentée, collecticiel, mobilité
(3)    Analyse de l'utilisateur et de son activité : modèles cognitifs, modèles utilisateur et modèles de l'activité
(4)    Conception : tâches, critères ergonomiques, interface abstraite et concrète, spécification (User Action Notation)

(1)    Brief History of Human-Computer Interaction
(2)    Interaction paradigms: Augmented Virtuality/Reality, groupware and mobile HCI
(3)    Analysis: cognitive models, models of the user and of the activity
(4)    Design methods: tasks, ergonomic criteria, abstract and concrete user interfaces, specification (User Action Notation)

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- Maîtriser l'utilisation de spécifications lors des étapes d'analyse et de conception d'un système d'information
- Savoir faire le lien entre le problème, exprimé de manière a priori informelle par un client, et le produit informatique, implanté

- Introduction : Rôles des modèles et langages de spécification
- Schémas UML au niveau conception : Classes, Objet, Collaboration, Séquence
- Génération de code (Java et SQL) à  partir d'UML
- Rétro-conception à  partir du code Java
- Schémas UML au niveau analyse

- Introduction: Role of models and specification languages
- UML diagrams in design: Classes, Objects, Collaboration, Sequence
- Code generation (Java and SQL) from UML
- Reverse engineering from Java code
- UML diagrams in analysis: Use Case, Class,...

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Introduction à  l'anglais médicale
Élargir le vocabulaire spécialisé dans le domaine médical.

1. Apprentissage du vocabulaire de base dans le domaine médicale:
   - Le corps humain, les maladies courantes, les instruments médicaux
2. Compréhension écrite :
   - Étude de textes dans le domaine médical
   - Recherche d'informations sur une procédure chirurgical
3. Compréhension orale :
   - Documents vidéo traitant du premier secours
   - Documents vidéo traitant d'une procédure chirurgicale
   - Comprendre un diagnostique médical
4. Expression orale :
   - Questionner un patient
   - Présenter une procédure chirurgicale
   - Débat sur une question d'éthique médicale
5. Expression écrite :
   - Résumé d'une présentation
   - Tests de vocabulaire

1. Basic medical vocabulary
   - The Human Body, basic ailments, mecial instruments
2. Reading:
   - Specialized texts on medical innovations
   - Research on a surgical procedure
3. Listening:
   - First Aid videos
   - Surgical procedure videos
   - Understanding a medical diagnosis
4. Speaking:
   - Dealing with a patient
   - Presenting a surgical procedure
   - Taking part in a debate on medical ethics
5. Writing:
   - Summary of a presentation
   - Vocabulary tests

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- Connaître l'environnement juridique auquel pourra être confronté l'ingénieur.
- Pouvoir identifier les obligations et les droits dans un contrat, savoir à  quel service ou quel organisme s'adresser pour toute relation juridique concernant l'ingénieur.

Notions sur le droit des contrats . Notions sur le droit des sociétés et les créations de société. Notions sur le droit des prestations de services. Notions sur le droit de la responsabilité . Notions sur la propriété industrielle et particulièrement le brevet d'invention.

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Connaître le droit des marchés publics.
Savoir faire une offre à  un acheteur public et savoir communiquer avec lui.

- Le domaine des marchés publics
- Les procédures de passations des marchés publics
- L'exécution des marchés publics
- L'inexécution des marchés publics

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L'objectif de ce cycle de sport en première année est double : progresser dans l'activité et développer ses propres compétences sociales :
- Apprendre à  gérer de nouvelles situations, souvent complexes, à  risques et stressantes ;
- Formaliser, verbaliser les difficultés rencontrées, travailler en équipe ;
- Mieux se connaître, se dépasser, résister à  l'effort ;
- Anticiper, identifier, résoudre seul et en groupe les problèmes qui se présentent dans la    pratique de l'activité ;
- Intégrer le sport dans un équilibre de vie, dans une stratégie de bien être, de santé et de sécurité ;
- Favoriser l'intégration, la solidarité.

Au travers d'une activité sportive support de l'enseignement, l'étudiant identifie un problème qui le concerne dans sa pratique et propose des solutions pour parvenir à  surmonter/résoudre ce problème. Ces solutions sont testées sur le terrain tout au long du cycle, puis validées, ou non.
Ainsi, plus que la notion de niveau technique dans l'activité, c'est vraiment la capacité de l'étudiant à  analyser sa pratique et son comportement qui nous intéresse ici.

Intended learning outcomes is double: Progress in the sport activity and devellop own social competence:
- Be abble to manage self stress
- Be abble to says few words about self and team problems witch ocured
- Learn about myself in an hight effort
- Practice sport also with an healf goal

Through a sporting medium of instruction, the student identifies a problem that concerns him in his practice and offers solutions for how to overcome / solve this problem. These solutions are field-tested throughout the cycle, then validated, or not.
Thus, as the notion of technical level in the business, it's really the ability of students to analyze their practices and behavior of interest here.

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- Connaître le marché du secteur de la santé
- Apprendre à  visiter un salon professionnel de manière efficace
- « Vendre » son entité d'appartenance

1. Présentation du salon
2. Préparation personnelle
3. Visite avec interviews d'industriels
4. Restitution

1. How to visit
2. Preparation
3. Visit with interviews

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Objet du cours : Initiation aux statistiques inférentielles : statistiques descriptives, comparaisons, régression simple.
Compétences visées : être en mesure de faire des tests inférentiels et de la régression linéaire sur des cas concrets du domaine de la santé sous R.

(1) Introduction à  R.
(2) Introduction aux statistiques : statistiques descriptives; notion de test d'hypothèse; réalisations, variance, risque et p-valeur.
(3) Tests statistiques : discussion autour de la p-valeur; conditions de validité de tests; tests d'ajustement, tests de conformité, tests d'homogénéité et tests d'association; comparaisons de moyennes, de variances, de distributions; tests paramétriques et non paramétriques; tests d'indépendance.
(4) Régression et corrélation : introduction à  l'ajustement de données et à  la modélisation statistique; régression linéaire; corrélation; qualité de la régression; tests sur la régression.

(1) Introduction to R.
(2) Introduction to statistics: descriptive statistics; concept of hypothesis testing, probabilistic events, variance, p-value and risk.
(3) Statistical tests: discussion about the p-value; conditions of validity, adequacy testing, fit testing, homogeneity tests and association tests, comparisons of means, variances, distributions, parametric and nonparametric tests; Chi squared.
(4) Regression and correlation: introduction to data fitting and statistical modeling, linear regression, correlation, quality of regression, tests on the regression.

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- Dispositifs médicaux et technologies associées
- Appréhender la transversalité de la physique et de la technologie des Dispositifs Médicaux

1. Types de Dispositifs Médicaux
2. Technologies associées
3. Analyse des principes physiques : études de cas

1. Types of Medical Devices
2. Associated technologies
3. Analysis of physical principles : case studies

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L'étudiant suit 4 modules, au choix, de sciences humaines et sociales.
L'objectif commun est d'approfondir les connaissances dans les domaines de la gestion, du management et du droit, et de favoriser une ouverture sur les problématiques actuelles de l'entreprise.

Modules au choix :
- Création d'entreprise
- Droit du travail
- Droit et Internet
- Éthique et développement durable
- Gestion de projet
- Hygiène et sécurité
- Management psychologique des hommes et des organisations
- Marketing
- Passeport Service
- Propriété industrielle
- Qualité

Student follows43 modules, at her/his choice, of management methods and social sciences.
The common goal is to have basis in project management and develop an openness in the current issues of the world of work and sustainable development.

Elective courses :
- Entrepreneurship
- Labor Law
- Law and Internet
- Ethics and sustainable development
- Project management
- Hygiene and security
- Psychological management of people and organizations
- Marketing
- Passeport Service
- Patent right
- Quality

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- Renforcement des capacités de communication et de compréhension acquises en 3ème année
- Introduction à  la communication en entreprise
- Étude de l'anglais de spécialité
- Préparation pour l'examen BULATS

1. Anglais de spécialité
   - Vocabulaire lié au domaine de technologie pour la santé, lecture semi-guidée ou autonome d'articles spécialisés
   - Processus naturels et techniques (Séquence, Voix passive)
2. Introduction à  la vie en entreprise
   a. Vocabulaire et fonctions
      - Structure d'une société
      - Organigramme et responsabilités
      - Communication au téléphone
   b. Communication orale
      - Techniques de présentation orale
      - Chaque étudiant présentera une société
      - Savoir conduire et participer à  une réunion, discussion
   c. Communication écrite
      - Rédaction d'un compte rendu
      - Rédaction d'un résumé
3. Préparation au TOEIC.
   - Chaque étudiant préparera le TOEIC, et le passera dans le courant de l'année

Groupe avancé :
- Conduite d'un projet fictif dans le domaine de la technologie pour la santé
- Cahier des charges, répartition et suivi dans un groupe, étude de cas, présentation

1. Specialized English in Health Techology
   - Specialized articles for comprehension, vocabulary and discussion
   - Processes, natural and technical
2. Introduction to Business English
   a. Vocabulary and functions
      - Company organization
      - Organisation charts
   b. Speaking skills
      - Oral presentation techniques
      - Company presentation
      - How to take part in a meeting
   c. Writing skills
      - Writing up minutes
      - Summary writing
3. TOEIC preparation
   - Students prepare and sit the TOEIC during the year

Advanced groups:
- Management of an imaginary project in the field of
- Health Technology
- Drawing up specifications, distribution and follow up of group work, case study, presentations

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OBJECTIFS :
- Connaître le système de santé et l'organisation des soins en France

COMPÉTENCES VISÉES :
- Dispositifs médicaux, généralités  sur le développement du médicament, système de santé français, programme de médicalisation du système français, économie de la santé

Plan :
- Dispositifs médicaux
- Stérilisation
- Généralité sur le médicament, développement du médicament
- Informatisation du médicament en établissement de soins
- Dossier pharmaceutique partagé de ville
- Présentation générale du système de santé français, T2A
- Économie de la santé : Macroéconomie
- Éducation patient : EducAVK
- Projet WIKIPEDIA
- L'informatique en radiothérapie

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Comprendre les principales fonctions du corps humain, approche de la physiologie sous forme de systèmes: définition des éléments du système, échanges entre ces éléments, échanges avec d'autres systèmes et/ou le milieux extérieur.
Compétences visées : Maîtriser le vocabulaire associé aux principales fonctions du corps humain dans la perspective d'une communication efficace avec les professionnels du monde de la santé.

1) Endocrinologie
2) Cardiovasculaire
3) Cardiovasculaire et diabète
4) Digestion
5) Défenses de l'organisme
6) Reproduction-contraception

Understand the main functions of the human body, approach to physiology in the form of systems: definition of system elements, exchanges between these elements, exchanges with other systems and / or the external environment.
Skills targeted: Master the vocabulary associated with the main functions of the human body in the perspective of effective communication with medical professionals.

1) Endocrinologie
2) Cardiovasculaire
3) Cardiovasculaire et diabète
4) Digestion
5) Défenses de l'organisme
6) Reproduction-contraception

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Conforter ou acquérir les bases de la biologie cellulaire, notions d'immunologie.
Introduire aux méthodes modernes d'imagerie (fluorescence).

 I. La cellule, structures-fonctions
   - Rappel sur la structure des cellules Eucaryote/Procaryote
   - Réseaux de membranes internes/Compartimentation et fonctions cellulaires
   - Adhérence et interactions cellulaires, Mouvement et mobilité, cytosquelette. Les molécules impliquées
   - Exemples de fonctions transmigration leucocytes, apoptose et phagocytose.
 II. Méthodes d'études
   - Introduction à  la culture de cellules eucaryotes. Pourquoi ? Comment ?
   - La microscopie et les outils moléculaires associées (ex protéines GFP)

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Donner à  des non-spécialistes de l'électronique  les notions de base en électronique analogique et numérique leur permettant de travailler en collaboration avec des électroniciens afin de choisir les éléments nécessaires à  la constitution d'une chaîne de mesure simple.

1. Chaîne d'acquisition, les différents constituants
2. Les signaux et systèmes analogiques  : représentation temporelle et fréquentielle. 
3. Éléments sur les dipôles électriques - Notions sur les capteurs
4. L'amplification
5. Le filtrage
6. Échantillonnage - CAN - CNA

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OBJECTIFS :
- Compréhension du fonctionnement des microcontrôleurs dans l'optique de leur utilisation dans des systèmes d'acquisition, de traitement des signaux et dans l'appareillage médical. L'illustration est faite en utilisant les ressources d'un microcontrôleur HCS12 (Freescale) préinstallé sur une platine de  développement munie d'interfaces d'entrée/sortie.
- Introduction au fonctionnement des microcontrôleurs du marché actuel et aux mécanismes mis en œuvre pour obtenir des gains de performances.

COMPÉTENCES VISÉES :
- Analyse des interfaces entre les appareils, les dispositifs médicaux et les capteurs  (nature, support physique, protocoles, débit ).
- Analyse des besoins en performances nécessaires à  l'intégration d'algorithmes de traitement de signaux dans les systèmes embarqués et miniaturisés.
- Définition de cahier des charges pour Dispositifs Médicaux.

1) Architecture des microcontrôleurs :
Architecture, fonctionnement, environnement matériel, types de mémoire.

2) Programmation :
Langage machine, codage de l'information (bases de numération binaire,décimale, hexadécimale, code ASCII), Arithmétique simple et multiple précision, Conversions. Modes d'adressage et structures de données(tableaux de variable simples et structurées). Notions de fonctions. Passage de paramètres.  Langages évolués.
Gestion d'événements par sondage (polling) et par interruptions. Notions de temps réel.

3) Interfaces et périphériques :
Interface de communication série (SCI), d'acquisition (ADC) et de séquencement (Timer) Ports d'E/S tout ou rien. Intégrations de périphériques en utilisant des bibliothèques disponibles ou à  créer (ADC,). Mise en œuvre de l'échantillonnage d'un signal analogique (ADC et Timer).

4) Conception des applications, Mini-projet :
Le module se termine par la réalisation d'un mini-projet synthétisant les connaissances acquises et permettant d'établir un lien avec les autres enseignements tels que le traitement du signal, l'électronique, la conduite de projets.
Exemple : Traitement du signal ECG en temps réel : Ce projet prend la suite d'un BE de Traitement du signal sur la mesure de l'arythmie respiratoire sinusale. Tous les traitements (filtrage numérique) ont jusqu'alors été réalisés en temps différé, sous Matlab. Le but est de les implémenter en version temps réel dans le microcontrôleur HCS12.

1) Microcontrollers: Architecture, Memory types, I/0.
2) Programming of Microcontrollers: Basics of machine level and high level programming, data encoding, data types, functions, Event management (polling and interrupt methods).
3) Peripheral Interfaces (Serial, ADC, Timers, Digital I/O, Analog I/O (ADC/DAC). Analog signal sampling and acquisition. Real-time processing.
4) Synthesis Project: Measuring and Display of Respiratory Sinus arrhythmia: Analog conditioning, sampling and processing of an ECG signal. This project uses basics of Application analysis, Analog electronics, Microcontroller programming and Signal processing.

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Objectifs :

Acquisition de connaissances relatives aux secteurs des technologies et services pour la santé et l’autonomie, de la e-santé et de la Silver économie.
Acquisition de méthodes de conception, d’évaluation multicritère et de déploiement de technologies et de services innovants pour la santé et l’autonomie.

Plan :

- Présentation des secteurs des technologies et services pour la santé et l'autonomie, de la e-santé et de la Silver économie.
- Intervention de divers acteurs publics et privés.
- Présentation et applications de méthodes et outils de conception, d’évaluation multicritère et de déploiement de technologies et de services innovants pour la santé et l’autonomie.

Outline:

- Overview of the sectors of technologies and services for health and autonomy, e-health and Silver Economy.
- Intervention of various private and public economic actors.
- Overview and implementation of methods and tools for conception and assessment of health and autonomy technologies

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- Projet d'assistance à  la maîtrise d'ouvrage en instrumentation et/ou informatique
- Spécification de projets multidisciplinaires
- Maitrise d’œuvre en traitement du signal
- Travail collaboratif par groupes de 6 élèves

1. Conception, validation et déploiement d'infrastructures intelligentes pour l'aide à  la personne.
2. Définition du cahier des charges d'un instrument qui pourrait ensuite être développé par des projets d'autres filières.
3. Spécifications techniques et fonctionnelles.
4. Maitrise d’œuvre des composants qui relèvent spécifiquement des compétences TIS (signaux physiologiques, ergonomie,...)
5. Le contexte et le sujet du projet changent chaque année.
6. Interventions d'enseignants ou d'extérieurs adaptées en fonction du sujet.

- Owner assistance project in instrumentation or computer science
- Specification of multidisciplinary projects
- Project management in signal processing
- Collaborative work in groups of 6 students

1. Design, validation and deployment of intelligent devices for human assistance.
2. Technical and functional specifications.
3. Project management of the components that specifically fall under the TIS competences (physiological signals, ergonomics, ...)
4. The context and topic of the project change each year.
5. Interventions of teachers or external people adapted according to the subject.

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- Concepts et outils du traitement du signal numérique
- Mise en pratique des notions de traitement du signal avec des bureaux d'études numériques sous environnement Matlab ou Simulink
- Application à  des signaux physiologiques

Plan du cours
1. Révisions de théorie du signal
2. Signaux numériques et transformée de Fourier de signaux à  temps discret
3. Transformée de Fourier Discrète
4. Systèmes numériques
5. Synthèse de filtres FIR

Plan des TP associés
1. Initiation à  Matlab
2. Corrélation numérique
3. Analyse spectrale numérique
4. Filtrage numérique décliné sur des TP applicatifs
- Suivi de l'arythmie sinusale d'origine respiratoire
- Calcul d'un indice de co-contraction sur signaux EMG

- Concepts and tools of digital signal processing
- Practical work in Matlab or Simulink environment
- Application to physiological signals

Course Map
1. Digital Signals and Fourier Transform of digital Signals
2. Discrete Fourier Transform
3. Digital systems
4. Synthesis of FIR filters

Associated practical works
1. Initiation to Matlab
2. Correlation
3. Spectral analysis
4. Digital filtering applied on physiological signals
- Respiratory sinus arrhythmia
- Computation of a co-contraction index on EMG signals

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- Connaître le fonctionnement d'un système de recherche d'information généraliste
- Être sensibilisé à  la recherche d'information de documents médicaux
- Pouvoir évaluer un système de recherche d'information

Plan:

- Modèles de Recherche d'Information
- Systèmes de Recherche d'Information
- Évaluation de systèmes de recherche d'Information
- Recherche de documents médicaux avec Mesh/Medline
- Recherche de documents multimédia

Outline:

- Information Retrieval Models
- Information Retrieval Systems
- Evaluation of Information Retrieval Systems
- Retrieval of medical documents using Mesh/Medline
- Multimedia Information Retrieval

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Connaître les principes physiques (ou biologiques le cas échéant), divers éléments technologiques de base et les applications médicales des techniques d'imagerie médicale "lourdes" (échographie, rayons X, IRM, médecine nucléaire) et de la radiothérapie.
Apport à  la culture dans le domaine de l'instrumentation biomédicale.

- Médecine nucléaire: Bases physiques (2h) et applications médicales (2h)
- Imagerie RX : Bases physiques (6h) et applications médicales (2h)
- Ultrasons: Bases physiques (2h)
- Imagerie par résonance magnétique: Bases physiques (4h) et applications médicales (2h)
- Radiothérapie: Principe (2h) Le parcours du patient (2h)
- Caractérisation de l'image: 2h
- Travaux diriges: 3 séances de 2h

L'ordre des thèmes abordés peut varier. Il est fait appel à  des enseignants différents pour chaque thème en fonction de leur spécialité.

- Nuclear medicine: Physical principles (2h) and medical applications (2h)
- X-ray imaging: Physical principles(6h) and medical applications (2h)
- Ultrasound imaging: Physical principles (2h)
- Magnetic resonance imaging: Physical principles (4h) and medical applications (2h)
- Radiotherapy: Principle (2h) Implementation (2h)
- Image Characterization: 2h
- Problem sessions: 3x2h

The various topics are presented by different lecturers and the order can vary.

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Présenter des méthodologies de gestion de projet et de génie logiciel.
Fournir aux étudiants une culture et certaines pratiques du travail en équipe.

Partie 1 : gestion de projet
- Project Maturity Flow
- Project Monitoring
- Planning et évaluation
- Approches agiles
- Études de cas (tirées de l'actualité)

Partie 2 : génie logiciel
- Gestion de configuration (git)
- Méthodologies de conceptions et revues projets
- Métriques et méthodes d'estimations
- Exigences, test et validation

Methodology for project management and software engineering.

Part 1: project management
- Project Maturity Flow
- Project Monitoring and evaluation
- Agile approach (scrum)

Part2: software engineering
- Project configuration
- Project review
- Metrics and estimations
- Requirement, tests and validation

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- Comprendre la problématique de l'interopérabilité
- Savoir utiliser un message HL7

1. Le rôle de l'interopérabilité
2. HL7
3. IHE
4. Connectathon

- Understand interoperability issues in IT systems
- Basic knowledge about HL7 standard

1. Interoperability
2. HL7
3. IHE
4. Connectathon

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- Renforcement des capacités de communication et de compréhension acquises en 3ème année
- Introduction à  la communication en entreprise
- Étude de l'anglais de spécialité
- Préparation pour l'examen BULATS

1. Anglais de spécialité
   - Vocabulaire lié au domaine de technologie pour la santé
   - Lecture semi-guidée ou autonome d'articles spécialisés
   - Compréhension et relevée de vocabulaire spécialisé
   - Processus naturels et techniques
     a. Séquence
     b. Voix passive
2. Introduction à  la vie en entreprise
   a. Vocabulaire et fonctions
      - Structure d'une société
      - Organigramme et responsabilités
      - Communication au téléphone
   b. Communication orale
      - Techniques de présentation orale
      - Chaque étudiant présentera une société
      - Savoir conduire et participer à  une réunion, discussion
3. Préparation au Toeic.
   - Chaque étudiant préparera le Toeic, et le passera dans le courant de l'année

Groupe avancé :
  - Conduite d'un projet fictif dans le domaine de la technologie pour la santé
  - Cahier des charges, répartition et suivi dans un groupe, étude de cas, présentation

1. Specialized English in Health Techology
   - Specialized articles for comprehension,  vocabulary and discussion
   - Processes, natural and technical
2. Introduction to Business English
   a. Vocabulary and functions
      - Company organization
      - Organisation charts
   b. Speaking skills
      - Oral presentation techniques
      - Company presentation
     -  How to take part in a meeting
   c. Writing skills
      - Writing up minutes
      - Summary writing
3. Toeic preparation
   - Students prepare and sit the Toeic during the year

Advanced groups:
     - Management of an imaginary project in the field of Health Technology
     - Drawing up specifications, distribution and follow up of group work, case study, presentations

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Maitriser les principaux outils de gestion d'entreprise (comptabilité générale et de gestion), comprendre les liens entre les différents acteurs internes de l'entreprise (production, marketing, stratégie générale).
Simulation de gestion en groupes de 3 étudiants, en concurrence sur le même marché.

1/ Apports théoriques : Le compte de résultat, le bilan , la trésorerie, le calcul du coût de revient
2/ Simulation de gestion : 5 décisions de gestion équivalant à  5 années d'exercice
3/ Évaluation : écrite individuelle (apports théoriques) et soutenance orale en groupe (simulation de gestion)

Master the main business management tools (general accounting and management), understand the links between the various internal actors of the company (production, marketing, general strategy).
Management simulation in groups of 3 students, competing in the same market.

1/ Theoretical reports: Income statement - balance sheet - cash flow - costing
2/ Management simulation: 5 management decisions equivalent to 5 years of practice
3/ Evaluation: individual written (theoretical contributions) and oral defense in group (management simulation)

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Connaître les mécanismes généraux de la comptabilité hospitalière.
Savoir comprendre le principe de la comptabilité hospitalière pour communiquer avec les hôpitaux et leurs services financiers.

- Les grands principes de  la comptabilité publique.
- Le financement des  établissements publics de santé.
- Le budget des établissements de santé (EPRD) et sa procédure d'élaboration.
- La tarification hospitalière, les recettes et les dépenses.
- L'exécution du budget.
- Le contrôle du budget des établissements publics de santé.
- La comparaison avec un établissement de santé privé.

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- Résolutions approchées de problèmes numériques liés à  la discrétisation
- Utilisation et comparaison d'algorithmes et de méthodes numériques pour trouver une solution
- Avoir une bonne notion des limites de ces méthodes (précision, rapidité).

Plusieurs chapitres :
- Équations non-linéaires
- Système d'équations linéaires
- Interpolation
- Équations différentielles

- Approximate resolutions of numerical problems
- Use and comparison of algorithms and numerical methods
- Analysis of the methods limits (precision, speed).

Several chapters:
- Non-linear equations
- Linear systems
- Interpolation
- Ordinary differential equations

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Objet du cours : Modélisation statistique et analyse multivariée.

Compétences visées : être en mesure de réaliser des analyses multivariées et des modèles sur des cas concrets du domaine de la santé sous R. Les étudiants sont capables de découvrir, analyser et interpréter des données nouvelles et complexes, d'établir des modèles de régression multiple pertinents, de réaliser des modèles de classifications (et d'appliquer des techniques de classification supervisées et non supervisées), de tester la robustesse de leur modèles.

(1) Régression multivariée : introduction à  l'analyse multivariée et à  la régression linéaire multiple ; estimation et prédictions (bandes de confiance) ; régression polynomiale ; modèle linéaire généralisé; régression de Poisson ; régression logistique ; qualité d'un modèle (bootstrap, split & cross validation, AIC ...).
(2) ANOVA - ANCOVA, dont : formalisme, modèles types, types d'ANOVA (I, II, III), tests à  postériori.
(3) Réduction et Classification : ACP ; méthodes de classification ; méthodes des distances (K-means, classification hiérarchique) ; recherche de mélanges gaussiens ; Analyse discriminante ; Analyse en correspondances multiples ; Relation de ces méthodes avec la régression et l'ANOVA ; recherche de modèles.

(1) Multivariate regression : introduction to multivariate analysis and multiple linear regression, estimation and predictions (confidence bands), polynomial regression, generalized linear model, Poisson regression, logistic regression, quality of a model (bootstrap, split & cross validation, AIC ...).
(2) ANOVA - ANCOVA, including: formalism, typical models, types of ANOVA (I, II, III), a posteriori tests.
(3) Reduction and Classification: Principal component analysis; methods of classification: distance-based methods (K-means and hierarchical clustering); gaussian mixtures; discriminant analysis; multiple correspondence analysis; relations with regression and ANOVA; looking for models.

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Objet du cours : Réduction de dimensions, analyse de données multidimensionnelles, classification

Compétences visées : être en mesure d'analyser des données multivariées provenant d'études médicales sur cohortes, d'images médicales ...
Les étudiants mettent en pratique des solutions d’ingénierie faisant intervenir divers outils mathématiques, statistiques et informatiques, en utilisant le langage MATLAB au cours de bureaux d'étude pour résoudre des problèmes concrets sur données réelles.

1. Introduction générale sur les méthodes de traitement de données multidimensionnelles
2. Méthode factorielle de réduction de la dimension: l'analyse en composantes principales (ACP)
3. Méthode de classification: analyse linéaire discriminante (AD)

Similar to MSS2 (multivariate analysis) with a reinforcement in PCA and LDA methods.

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- Comprendre les problématiques et le fonctionnement des réseaux
- Sélectionner une infrastructure en fonction des propriétés applicatives souhaitées
- Comprendre les risques de sécurité et connaître des mesures pour y remédier

1. Introduction
2. Couche application
3. Couche transport
4. Couche réseau
5. Couche liaison et physique
6. Sécurité
7. Réseaux sans-fil

- Understand the problems and mechanisms involved in computer networks
- Select an infrastructure according to some application requirement
- Security risks and how to prevent them

1. Introduction
2. Application layer
3. Transport layer
4. Network layer
5. Link and physical layers
6. Security
7. Wireless networks

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- Comprendre les différentes technologies XML
- Savoir utiliser l'extensibilité et la modularité des langages à  balises
- Manipuler, modéliser et programmer des structures XML
- Savoir développer des services web (SOA)

Des données aux programmes :
- Rappel sur XML
- Analyse de document (technologies DOM, SAX, StAX)
- Navigation (technologie XPath)
- Transformation (technologie XSLT)
Des programmes aux services :
- Modélisation (technologie XML Schema)
- Data-Binding (technologie compilateur de schema)
- Service Oriented Architecture (SOA)
- Web Services (technologies WSDL/Soap, ReSTful)

- Understand the main technologies based on XML
- Know how to use the modularity and extensibility of markup languages
- Process, model and program application using XML-based data
- Know how to develop web services

From data to programs:
- XML starter
- Analyze using parsers (DOM, SAX, StAX)
- Navigate (XPath)
- Transform (XSLT)
From programs to services:
- Modeling (XML Schema)
- Data-Binding (XML Schema compiler)
- Service Oriented Architecture (SOA)
- Web Services (WSDL/Soap, ReSTful)

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OBJECTIFS :
- stage en milieu industriel à  la fin de la quatrième année. Le stage doit intégrer une composante biologique ou médicale, et si possible valoriser la polyvalence de nos élèves dans les domaines du logiciel et du traitement du signal et de l'image.

COMPÉTENCES VISÉES :
- stage d'application (sur un cahier des charges élaboré au préalable par l'entreprise) permettant la mise en pratique des connaissances acquises par l'élève.

durée : 3 à  4 mois (minimum : 12 semaines)

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OBJECTIFS :
- Stage d'immersion en milieu hospitalier afin de connaître les métiers de la santé centré sur la découverte du monde médical. Les unités de soins accueillant des patients concernées sont: médecine et chirurgie. L'objectif du stage est de participer à  toutes les activités de l'équipe médicale (recueil d'observations avec les externes, visites et contre visites, consultations, blocs opératoires, réunions de service.....). Au cours de ces 15 jours, quelques demi-journées seront consacrées à  la découverte du plateau technique.
- Dialogue et interaction avec les médecins. Les étudiants seront également à  disposition au cours du stage pour aider ou conseiller sur des besoins informatiques spécifiques.

COMPÉTENCES VISÉES :
- Connaissance du fonctionnement du monde hospitalier indispensable à  leur futur métier.
Les stagiaires doivent être capables de présenter un dossier médical, d'analyser l'usage actuel de l'informatique dans l'exercice médical et être capable de comprendre les besoins des médecins dans ce domaine.

Durée : 2 semaines

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Disposer d'un CV valorisant et communicant, avec modèle lettre de motivation simple, personnelle et efficace
Savoir écrire et mettre à jour sa page sur les réseaux sociaux professionnels,
Se préparer aux entretiens en connaissant le déroulé type et sa présentation orale personnelle
Déroulé d'un entretien

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Différentes options sont proposées en anglais en Tronc Commun :

-  Préparation au TOEIC ou au BULATS
-  English for Today's World : l'anglais de l'actualité
-  America On Screen : étude de la société américaine à travers des films contemporains
-  International Business
-  Proficiency English : étude de la langue niveau avancé

According to each option

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Savoir identifier, adapter et mettre en œuvre des Design Patterns.

- Rôle des Design Patterns
- Étude des principaux Design Patterns
- Mise en œuvre des principaux Design Patterns

Know how to identify, adapt and implement Design Patterns.

- Role of Design Patterns
- Study of the main Design Patterns
- Implementation of the main Design Patterns

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Appréhender les différentes étapes permettant la conception, la réalisation et la validation de systèmes à  base de connaissances. Les méthodes et outils présentés permettront de préciser les apports liés à  la représentation de connaissances symboliques et incomplètes. Ce cours tient compte de la spécificité de la formation ingénierie de la santé, sans omettre pourtant de présenter les méthodes de façon générique.

Compétences visées :
Le web sémantique/web des données fournit un cadre général qui permet l'échange, le partage et la réutilisation de données entre applications au travers des entreprises et des communautés d'utilisateurs. C'est le fruit d'un effort collaboratif mené par le World Wide Web Consortium (W3C) avec la participation de nombreux partenaires issus du monde de la recherche et de l'industrie. Ce cours se focalisera sur certaines des technologies standardisées par le W3C et qui sont au cœur du web sémantique/ des données : RDF et SPARQL permettent l'échange et l'interrogation des données, RDFS et OWL offrent l'expressivité nécessaire à  la modélisation d'ontologies. La présentation en cours de ces différents langages sera complétée par des exercices pratiques sur machine (avec le framework Java Jena et l'éditeur d'ontologies Protégé-OWL) qui permettront aux étudiants de se confronter directement et concrètement avec la mise œuvre du web sémantique.

Ce cours vise les objectifs suivants :
    - présenter les principes à  la base du web sémantique
    - fournir les connaissances nécessaires à  la compréhension des technologies utilisées pour la mise en œuvre du web sémantique
    - présenter l'état actuel du développement du web sémantique
    - comprendre les défis techniques liés à  la réalisation du web sémantique
Au terme de ce cours, l'étudiant sera en mesure de :
   - saisir clairement les enjeux liés aux techniques du web sémantique
   - connaitre les principaux langages utilisés dans les applications du web sémantique
   - comprendre une architecture simple pour le web sémantique
   - construire une ontologie dans le but d'une intégration au web sémantique

Partie 1 : Ontologies et web sémantique/ web des données
Partie 2 : Représentation de connaissances incomplètes
- Intérêts et principe
- Représentation de connaissances incomplètes
- Raisonnement avec des connaissances incomplètes : principe de l'inférence bayésienne
- Méthodes de simplification symbolique pour l'inférence bayésienne
- Apprentissage à  partir de données

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- Introduction générale à  la modélisation en médecine et biologie
- Définition et apports de la modélisation en médecine et biologie, à  partir d'une thématique choisie (le thème abordé est la ventilation artificielle)
- Description et implémentation d'un modèle connu du système respiratoire
- Mise en place d'un simulateur d'assistance ventilatoire qui permettra de comparer les caractéristiques de différents modes d'assistance
- Utilisation de la modélisation pour l'analyse et la représentation de signaux physiologiques

Cours (4h) : Introduction à  la modélisation
Cours (2h) : Présentation de la thématique et du contexte de la ventilation artificielle
Rappel de cours et TP (4h) : Résolution numérique d'équations différentielles
TP (4 séances de 4h) : Projet d'assistance ventilatoire
TP (2 séances de 4h) : Interactions cardio-respiratoires, modélisation et représentation de signaux physiologiques

- General introduction to the modelling in medicine and biology
- Definition and contributions based on a chosen theme (artificial ventilation)
- Simulation of an existing model of spontaneous breathing
- Modelisation of the interactions with mechanical ventilation

Introduction to modelling and simulation
Presentation of the artificial ventilation context
Numerical resolution of differential equations
Project of ventilatory assistance
Cardio-respiratory interactions : Modelling and representation of physiological signals

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- Rappeler les principes d'une démarche qualité
- Présenter les principes et l'organisation de gestion des risques et de la qualité en établissement de santé
- Assurance qualité et normes

1. Principes généraux : place de l'assurance qualité dans le marquage CE
2. Principes généraux : Les concepts de l'assurance qualité
3a. Management du système Qualité en conformité avec la norme ISO 13485
3b. Système qualité en développement
3c. Norme IEC 62304
4. Maitrise de la sous-traitance
5. Exemple de système qualité
6. L'audit

- Principles of a quality approach
- Principles and organization of risk management and quality in health institutions
- Quality and standards

1. General principles: place of quality insurance in the CE marking
2. General principles: The concepts of quality insurance
3a. Quality system management in accordance with ISO 13485
3b. Quality system in development
3c. IEC 62304 standard
4. Subcontracting
5. Example of a quality system
6. Audit

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Introduction au domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO) du point de vue ingénierie.
Après une introduction aux problématiques cliniques, ce cours couvre un état de l'art succinct des méthodes utilisées pour l'analyse d'images médicales (images 3D), la fusion d'images multimodales, la planification et la simulation de procédures chirurgicales ainsi que la chirurgie assistée par ordinateur.
Un mini-projet permet aux étudiants d'inventer un dispositif de GMCAO fictif, mais réaliste, afin de répondre à  un besoin chirurgical précis.
Un séminaire permet une rencontre avec des cliniciens, industriels ou chercheurs. Ils exposent leurs problèmes, produits et solutions.

- Introduction
- Imagerie
- Recalage
- Modèles et Simulateurs de Tissus Mous
- Robotique Médicale
- Séminaire ECCAMI : plateforme, projets et industriels
- TP CamiTK

- Introduction
- Medical Imaging
- Image Registration
- Modeling and Simulation of Soft Tissue
- Medical Robotics
- ECCAMI workshop: plateform, projects and products
- Tutorial CamiTK

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Comprendre les principales fonctions du corps humain, approche de la physiologie sous forme de systèmes: définition des éléments du système, échanges entre ces éléments, échanges avec d'autres systèmes et/ou le milieux extérieur.

Compétences visées : Maîtriser le vocabulaire associé aux principales fonctions du corps humain dans la perspective d'une communication efficace avec les professionnels du monde de la santé.

1) Locomotion et biomécanique du rachis
2) Sommeil normal et pathologique
3) Technologies informatiques et systèmes cardiovasculaires
4) Locomotion et biomécanique du rachis
5) Organe des sens
6) Physiologie de l'exercice
7) Biotechnologie de la thermodynamique et de la bioénergétique cardiaque
8) Sensibilité somatique et douleur

Understand the main functions of the human body, approach to physiology in the form of systems: definition of system elements, exchanges between these elements, exchanges with other systems and / or the external environment.

Skills targeted: Master the vocabulary associated with the main functions of the human body in the perspective of effective communication with medical professionals.

1) Locomotion and biomechanics of the spine
2) Normal and pathological sleep
3) Computer Technologies and Cardiovascular Systems
4) Locomotion and biomechanics of the spine
5) Body of the senses
6) Physiology of exercise
7) Biotechnology of cardiac thermodynamics and bioenergetics
8) Somatic sensitivity and pain

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Acquérir les concepts fondamentaux sous-jacents aux Réseaux de Santé, un des outils stratégiques dans l'organisation des soins au niveau national. Prendre conscience des différents aspects que peuvent recouvrir ces réseaux avec les évolutions futures envisagées. Découvrir, au cours d'une journée en médecine libéral, le point de vue d'un praticien.

Ce module est organisé en 7 cours. Le premier, a pour objet, d'exposer les principes génériques à  tout réseau de Santé. Les enseignements suivants rapportent différentes déclinaisons des réseaux de Santé selon le métier, que ce soit, dans le cadre de la télésanté (Quels services, enjeux et perspectives pour les territoires. Dernières avancées et retours d'expériences réussies), de l'Hospitalisation à  Domicile (Organisation et expériences en télémédecine), de soins de proximité dans le Vercors (une expérience d'organisation des soins de proximité en multidisciplinaire sur le territoire Vercors), de la maladie thrombo-embolique (l'expérience de GRANTED : le réseau grenoblois des pathologies vasculaires), du point de vue d'un industriel (MBAConsulting Réseau de Santé), ou encore du point de vue de la filière gériatrique (Réseau de soins, Filières, Structures, et Réseaux gériatriques).

Il est complété par une journée de stage en cabinet de médecine libérale, afin de pleinement appréhender la réalité pratique, l'ensemble des améliorations possibles et évolutions futures de ce domaine.

This module is organized into 7 lectures. The first aims at showing the generic principles of Health network. The following lectures are focused on different types of Health Network, including telemedicine, home care, community care, thromboembolic disease (GRANTED network), industrial point of view and geriatric point of view.

These lectures are illustred by a lesson in a medical center.

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- Représentation Temps-Fréquence des bio-signaux
- Maitrise des outils théoriques et d'algorithmes pour le traitement des signaux non-stationnaires

1. Signaux du vivant : un monde de signaux non-stationnaires
2. Limites de la Transformée de Fourier
3. Transformée de Fourier à  fenêtre
4. Transformée en ondelettes

Bureaux d'études :
- Spectrogramme
- Scalogramme
- Applications au traitement de signaux d'accélération glottique

- Time-frequency analysis of physiological signals
- Theoretical tools and numerical algorithms for non-stationary signals processing

1. Bio-signals : a world of non-stationnary signals
2. Fourier Transform limites
3. Short-time Fourier transform
4. Wavelet Transform

Practical works :
- Spectrogram
- Scalogram
- Applications to processing of accelerometric signals

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Comprendre les différents traitements sur l'image depuis son acquisition jusqu'à  l'extraction de caractéristiques.

- Introduction : du capteur à  l'image: contraintes liées à  l'échantillonnage et la quantification.
- Traitements de niveaux pixels : traitements pour la dynamique des niveaux de gris (ou couleurs)
- Filtrage linéaire spatial et fréquentiel
- Filtrage non-linéaire
- Segmentation contour et extractions de caractéristiques ( Transformée de Hough)
- Segmentation région (et extractions de caractéristiques (Méthodes morphologiques, Algorithmes de division-fusion)
- Notion d'Indexations d'images, cas en imagerie médicale
- Dernière partie : étapes de traitement d"images qui permettent d"analyser les données imagerie cérébrales anatomiques et fonctionnelles obtenues par IRM

- Introduction : sampling and quantization
- Low-level image processing
- Linear filtering (spatial and frequential)
- Non-linear filtering
- Edge segmentation (Hough transform)
- Region segmentation (morphological methods, split and merge algorithms)
- Image indexation

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À terme, ce module a vocation à  poursuivre ou compléter le projet d'Assistance à  la Maîtrise d'Ouvrage de TIS4.
Actuellement, les heures dédiées à  ce module sont consacrées à  la préparation du projet de fin d'études (TIS5). L'objectif est la rédaction d'un document type « proposition technique » décrivant le contexte, les enjeux, la compréhension du besoin, la solution, le pilotage, l'organisation et les engagements.

Travail en autonomie par groupe de 3 ou 4 étudiants dans les locaux de l'école.
Rédaction  d'une mission de cadrage, pour préparer la mission de réalisation (projet fin d'étude) :
- compréhension du besoin et des enjeux
- état de l'art
- solution proposée (maquettes, schémas, choix techniques)
- dispositif proposé (pilotage, localisation, charge et organisation de l'équipe)
- engagements pris  (délais, livrables, ...)

The objective is the writing of a type of document "technical proposal" describing the context, the stakes, the understanding of the need, the solution, the management, the organization and the commitments.

Self-employment by groups of 3 or 4 students in the school premises.
Writing a scoping mission, to prepare the mission of realization (end of study project):
- understanding the need and the issues
- state of the art
- proposed solution (models, diagrams, technical choices)
- proposed device (piloting, localization, charge and organization of the team)
- commitments made (deadlines, deliverables, ...)

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Disposer d'un CV valorisant et communicant, avec modèle lettre de motivation simple, personnelle et efficace
Savoir écrire et mettre à jour sa page sur les réseaux sociaux professionnels,
Se préparer aux entretiens en connaissant le déroulé type et sa présentation orale personnelle
Déroulé d'un entretien

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Différentes options sont proposées en anglais en Tronc Commun :

-  Préparation au TOEIC ou au BULATS
-  English for Today's World : l'anglais de l'actualité
-  America On Screen : étude de la société américaine à travers des films contemporains
-  International Business
-  Proficiency English : étude de la langue niveau avancé

According to each option

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 Acquérir :
  - Culture générale des écosystèmes Big Data
  - Notions d'architecture et d'intégration
  - Méthode de conception d'un lac de données
  - Méthodes et outils pour la collecte, l'organisation et l'exploration interactive de données massives et/ou complexes
  - Savoir-faire l'implémentation d'une plate-forme d'exploration de données de santé centré sur une base graphe

PARTIE THÉORIQUE (8H)
Partie 1 : Introduction / Contexte
- Big Data : définitions
- Regroupement de données
- Approche de construction d'un lac de données : workflow associé
- Les démarches péri-informatiques (gouvernance, CNIL, ?)
- Les écosystèmes autour du Big Data
- Considérations techniques (montée en charge, haute disponibilité, redondance, ...)

Partie 2 : Mise en œuvre sur un Entrepôt de Données de Santé (EDS)
- Contexte CHU
- Approche projet
- Workflow de traitements : ETL, Traitement, Accès
- Un exemple d'architecture générale
- Quelques outils indispensables
- Exemple d'un projet de EDS au CHUGA

Partie 3 : Conception d'un lac de données
- Contexte, objectifs, moyens.
- Concepts des bases graphes
- Domaines courants d'application
- Interopérabilité, web sémantique
- Du modèle à  la base orientée graphe
- Modèle pivot du lac, évolutions

Partie 4 : Implémentation d'une plate-forme interactive d'exploration de données complexes et massives
- Focus ArangoDB, Elastic, ETL, IHM
- Élaboration de données métier

PARTIE PRATIQUE (14H)
Partie 5 : Exercice de modélisation (2H)

Partie 6 : Mini-projet (12H)
Déployer un workflow de traitement de données : ETL, BD Graphe, Visualisation

Bilan des connaissances acquises (2H)

Acquire:
- General Culture of Big Data Ecosystems
- Architecture and integration concepts
- Method of designing a data lake
- Methods and tools for collecting, organizing and interactive exploration of massive and / or complex data
- Know-how implementation of a health data mining platform centered on a graph database.

THEORICAL PART (8H)
Part 1: Introduction / Background
- Big Data: Definitions
- Grouping of data
- Approach to build a data lake: associated workflow
- Peri-computing approaches (governance, privacy, ...)
- The eco-systems around Big Data
- Technical considerations (scalability, high availability, redundancy, ...)

Part 2: Implementation of a Health Data Warehouse (DHS)
- University Hospital of Grenoble Context
- Project approach
- Treatment Workflow: ETL, Treatment, Access
- An example of a general architecture
- Some indispensable tools
- Health Data Warehouse project example at the University Hospital of Grenoble

Part 3: Designing a data lake
- Context, objectives, means.
- Concepts of graph oriented databases
- Common areas of application
- Interoperability, semantic web
- From the model to the graph oriented database
- Pivot model of the lake, evolutions

Part 4: Implementation of an interactive platform for complex and massive data mining
- Focus ArangoDB, Elastic, ETL, HMI
- Business Data Development

PRACTICAL PART (14H)
Part 5: Modeling Exercise (2H)

Part 6: Mini-Project (12H)
Deploy a data processing workflow: ETL, BD Graph, Visualization

Assessment of acquired knowledge (2H)

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Savoir identifier, adapter et mettre en œuvre des Design Patterns.

- Rôle des Design Patterns
- Étude des principaux Design Patterns
- Mise en œuvre des principaux Design Patterns

Know how to identify, adapt and implement Design Patterns.

- Role of Design Patterns
- Study of the main Design Patterns
- Implementation of the main Design Patterns

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- Rappeler les principes d'une démarche qualité
- Présenter les principes et l'organisation de gestion des risques et de la qualité en établissement de santé
- Assurance qualité et normes

1. Principes généraux : place de l'assurance qualité dans le marquage CE
2. Principes généraux : Les concepts de l'assurance qualité
3a. Management du système Qualité en conformité avec la norme ISO 13485
3b. Système qualité en développement
3c. Norme IEC 62304
4. Maitrise de la sous-traitance
5. Exemple de système qualité
6. L'audit

- Principles of a quality approach
- Principles and organization of risk management and quality in health institutions
- Quality and standards

1. General principles: place of quality insurance in the CE marking
2. General principles: The concepts of quality insurance
3a. Quality system management in accordance with ISO 13485
3b. Quality system in development
3c. IEC 62304 standard
4. Subcontracting
5. Example of a quality system
6. Audit

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Introduction au domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO) du point de vue ingénierie.
Après une introduction aux problématiques cliniques, ce cours couvre un état de l'art succinct des méthodes utilisées pour l'analyse d'images médicales (images 3D), la fusion d'images multimodales, la planification et la simulation de procédures chirurgicales ainsi que la chirurgie assistée par ordinateur.
Un mini-projet permet aux étudiants d'inventer un dispositif de GMCAO fictif, mais réaliste, afin de répondre à  un besoin chirurgical précis.
Un séminaire permet une rencontre avec des cliniciens, industriels ou chercheurs. Ils exposent leurs problèmes, produits et solutions.

- Introduction
- Imagerie
- Recalage
- Modèles et Simulateurs de Tissus Mous
- Robotique Médicale
- Séminaire ECCAMI : plateforme, projets et industriels
- TP CamiTK

- Introduction
- Medical Imaging
- Image Registration
- Modeling and Simulation of Soft Tissue
- Medical Robotics
- ECCAMI workshop: plateform, projects and products
- Tutorial CamiTK

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Comprendre les principales fonctions du corps humain, approche de la physiologie sous forme de systèmes: définition des éléments du système, échanges entre ces éléments, échanges avec d'autres systèmes et/ou le milieux extérieur.

Compétences visées : Maîtriser le vocabulaire associé aux principales fonctions du corps humain dans la perspective d'une communication efficace avec les professionnels du monde de la santé.

1) Locomotion et biomécanique du rachis
2) Sommeil normal et pathologique
3) Technologies informatiques et systèmes cardiovasculaires
4) Locomotion et biomécanique du rachis
5) Organe des sens
6) Physiologie de l'exercice
7) Biotechnologie de la thermodynamique et de la bioénergétique cardiaque
8) Sensibilité somatique et douleur

Understand the main functions of the human body, approach to physiology in the form of systems: definition of system elements, exchanges between these elements, exchanges with other systems and / or the external environment.

Skills targeted: Master the vocabulary associated with the main functions of the human body in the perspective of effective communication with medical professionals.

1) Locomotion and biomechanics of the spine
2) Normal and pathological sleep
3) Computer Technologies and Cardiovascular Systems
4) Locomotion and biomechanics of the spine
5) Body of the senses
6) Physiology of exercise
7) Biotechnology of cardiac thermodynamics and bioenergetics
8) Somatic sensitivity and pain

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Acquérir les concepts fondamentaux sous-jacents aux Réseaux de Santé, un des outils stratégiques dans l'organisation des soins au niveau national. Prendre conscience des différents aspects que peuvent recouvrir ces réseaux avec les évolutions futures envisagées. Découvrir, au cours d'une journée en médecine libéral, le point de vue d'un praticien.

Ce module est organisé en 7 cours. Le premier, a pour objet, d'exposer les principes génériques à  tout réseau de Santé. Les enseignements suivants rapportent différentes déclinaisons des réseaux de Santé selon le métier, que ce soit, dans le cadre de la télésanté (Quels services, enjeux et perspectives pour les territoires. Dernières avancées et retours d'expériences réussies), de l'Hospitalisation à  Domicile (Organisation et expériences en télémédecine), de soins de proximité dans le Vercors (une expérience d'organisation des soins de proximité en multidisciplinaire sur le territoire Vercors), de la maladie thrombo-embolique (l'expérience de GRANTED : le réseau grenoblois des pathologies vasculaires), du point de vue d'un industriel (MBAConsulting Réseau de Santé), ou encore du point de vue de la filière gériatrique (Réseau de soins, Filières, Structures, et Réseaux gériatriques).

Il est complété par une journée de stage en cabinet de médecine libérale, afin de pleinement appréhender la réalité pratique, l'ensemble des améliorations possibles et évolutions futures de ce domaine.

This module is organized into 7 lectures. The first aims at showing the generic principles of Health network. The following lectures are focused on different types of Health Network, including telemedicine, home care, community care, thromboembolic disease (GRANTED network), industrial point of view and geriatric point of view.

These lectures are illustred by a lesson in a medical center.

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- Représentation Temps-Fréquence des bio-signaux
- Maitrise des outils théoriques et d'algorithmes pour le traitement des signaux non-stationnaires

1. Signaux du vivant : un monde de signaux non-stationnaires
2. Limites de la Transformée de Fourier
3. Transformée de Fourier à  fenêtre
4. Transformée en ondelettes

Bureaux d'études :
- Spectrogramme
- Scalogramme
- Applications au traitement de signaux d'accélération glottique

- Time-frequency analysis of physiological signals
- Theoretical tools and numerical algorithms for non-stationary signals processing

1. Bio-signals : a world of non-stationnary signals
2. Fourier Transform limites
3. Short-time Fourier transform
4. Wavelet Transform

Practical works :
- Spectrogram
- Scalogram
- Applications to processing of accelerometric signals

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Comprendre les différents traitements sur l'image depuis son acquisition jusqu'à  l'extraction de caractéristiques.

- Introduction : du capteur à  l'image: contraintes liées à  l'échantillonnage et la quantification.
- Traitements de niveaux pixels : traitements pour la dynamique des niveaux de gris (ou couleurs)
- Filtrage linéaire spatial et fréquentiel
- Filtrage non-linéaire
- Segmentation contour et extractions de caractéristiques ( Transformée de Hough)
- Segmentation région (et extractions de caractéristiques (Méthodes morphologiques, Algorithmes de division-fusion)
- Notion d'Indexations d'images, cas en imagerie médicale
- Dernière partie : étapes de traitement d"images qui permettent d"analyser les données imagerie cérébrales anatomiques et fonctionnelles obtenues par IRM

- Introduction : sampling and quantization
- Low-level image processing
- Linear filtering (spatial and frequential)
- Non-linear filtering
- Edge segmentation (Hough transform)
- Region segmentation (morphological methods, split and merge algorithms)
- Image indexation

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À terme, ce module a vocation à  poursuivre ou compléter le projet d'Assistance à  la Maîtrise d'Ouvrage de TIS4.
Actuellement, les heures dédiées à  ce module sont consacrées à  la préparation du projet de fin d'études (TIS5). L'objectif est la rédaction d'un document type « proposition technique » décrivant le contexte, les enjeux, la compréhension du besoin, la solution, le pilotage, l'organisation et les engagements.

Travail en autonomie par groupe de 3 ou 4 étudiants dans les locaux de l'école.
Rédaction  d'une mission de cadrage, pour préparer la mission de réalisation (projet fin d'étude) :
- compréhension du besoin et des enjeux
- état de l'art
- solution proposée (maquettes, schémas, choix techniques)
- dispositif proposé (pilotage, localisation, charge et organisation de l'équipe)
- engagements pris  (délais, livrables, ...)

The objective is the writing of a type of document "technical proposal" describing the context, the stakes, the understanding of the need, the solution, the management, the organization and the commitments.

Self-employment by groups of 3 or 4 students in the school premises.
Writing a scoping mission, to prepare the mission of realization (end of study project):
- understanding the need and the issues
- state of the art
- proposed solution (models, diagrams, technical choices)
- proposed device (piloting, localization, charge and organization of the team)
- commitments made (deadlines, deliverables, ...)

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Disposer d'un CV valorisant et communicant, avec modèle lettre de motivation simple, personnelle et efficace
Savoir écrire et mettre à jour sa page sur les réseaux sociaux professionnels,
Se préparer aux entretiens en connaissant le déroulé type et sa présentation orale personnelle
Déroulé d'un entretien

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Différentes options sont proposées en anglais en Tronc Commun :

-  Préparation au TOEIC ou au BULATS
-  English for Today's World : l'anglais de l'actualité
-  America On Screen : étude de la société américaine à travers des films contemporains
-  International Business
-  Proficiency English : étude de la langue niveau avancé

According to each option

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Il s'agit de présenter les exigences essentielles tout au long du cycle de vie du DM (conception, mise sur le marché, dossier technique, évaluation clinique, suivi du produit,), les normes applicables et la comptabilité et l'interopérabilité des DM2I.
L'enseignement est mise en pratique lors d'un petit projet.

PARTIE 1 : SÉCURITÉ SANITAIRE
1. Matériovigilance
2. Rappel de produits et actions correctives
3. Surveillance du marché

PARTIE 2 : CONCEPTION des DM
1. Les exigences essentielles
2. Revue des normes harmonisées européennes
3a. Norme pour l'aptitude à  l'utilisation d'un DM (Norme IEC 62366)
3b. Norme pour l'équipement médical électrique (Norme IEC 60601-1)
3c. Norme pour la gestion des risques des DM (Norme ISO 14971)
3d. Norme pour la biocompatibilité des dispositifs médicaux (Norme ISO 10993)
4. Étiquetage et notice
5. Élaboration d'un dossier technique
6. Évaluation clinique
Projet

- Present the essential requirements during medical device lifecycle (design, CE/FDA marking, technical documentation, clinical trials, product maintenance)
- Present the different regulations required to introduce a new medical device on the market

PART 1: HEALTH SAFETY
1. Device vigilance
2. Product recall and corrective actions
3. Market surveillance

PART 2: MEDICAL DEVICES DESIGN
1. Essential requirements
2. Review of the harmonised european standards
3a. Standarf for the application of usability engineering to medical devices (IEC 62366)
3b. technical standards for the safety and essential performance of medical electrical equipment (IEC 60601-1)
3c. standard for the application of risk management to medical devices (ISO 14971)
3d. standards for evaluating the biocompatibility of medical devices (ISO 10993)
4. Labeling and package
5. Technical dossier
6. Clinical evaluation
Project

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Ce cours de technologies des dispositifs médicaux intelligents et innovants a pour objectif de comprendre comment analyser, construire ou prendre en main un dispositif médical innovant complexe.
Ce cours explore l'aspect technologique des développements de Dispositifs Médicaux innovants où plusieurs technologies sont à  intégrer au sein d'une même application : imagerie, localisation d'instrument 3D, géométrie d'objets.

Ce module se déroule essentiellement sous forme de projet tutoré.
Ce projet s'intègre totalement dans une démarche d'apprentissage par projet dans le cadre de l'innovation dans le domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur. Il fait intervenir des professionnels notamment pour la gestion de projet pluridisciplinaires et les spécifications techniques appliquées au protocole clinique.

Plan :
1. Introduction
2. Rappels théoriques liés au projet
3. Formation à  l'atelier CamiTK
Projet

- Analyze, build or manage a complex innovative medical device
- Understand how an innovative medical device requires the combination of multiple technologies in one product: imaging, 3D instrument localizing, 3D geometry

This module is based on a guided project. The project integrates the discovery and understanding of medical device for computer assisted medical intervention. Experts of the domains help the students during the process, especially for the multidisciplinary project management and the technical specification applied for clinical protocol.

Outline:
1. Introduction
2. Theoretical reviews linked to the project
3. CamiTK Software Development Kit tutorial
Project

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- Rappeler les principes d'une démarche qualité
- Présenter les principes et l'organisation de gestion des risques et de la qualité en établissement de santé
- Assurance qualité et normes

1. Principes généraux : place de l'assurance qualité dans le marquage CE
2. Principes généraux : Les concepts de l'assurance qualité
3a. Management du système Qualité en conformité avec la norme ISO 13485
3b. Système qualité en développement
3c. Norme IEC 62304
4. Maitrise de la sous-traitance
5. Exemple de système qualité
6. L'audit

- Principles of a quality approach
- Principles and organization of risk management and quality in health institutions
- Quality and standards

1. General principles: place of quality insurance in the CE marking
2. General principles: The concepts of quality insurance
3a. Quality system management in accordance with ISO 13485
3b. Quality system in development
3c. IEC 62304 standard
4. Subcontracting
5. Example of a quality system
6. Audit

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Introduction au domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO) du point de vue ingénierie.
Après une introduction aux problématiques cliniques, ce cours couvre un état de l'art succinct des méthodes utilisées pour l'analyse d'images médicales (images 3D), la fusion d'images multimodales, la planification et la simulation de procédures chirurgicales ainsi que la chirurgie assistée par ordinateur.
Un mini-projet permet aux étudiants d'inventer un dispositif de GMCAO fictif, mais réaliste, afin de répondre à  un besoin chirurgical précis.
Un séminaire permet une rencontre avec des cliniciens, industriels ou chercheurs. Ils exposent leurs problèmes, produits et solutions.

- Introduction
- Imagerie
- Recalage
- Modèles et Simulateurs de Tissus Mous
- Robotique Médicale
- Séminaire ECCAMI : plateforme, projets et industriels
- TP CamiTK

- Introduction
- Medical Imaging
- Image Registration
- Modeling and Simulation of Soft Tissue
- Medical Robotics
- ECCAMI workshop: plateform, projects and products
- Tutorial CamiTK

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Comprendre les principales fonctions du corps humain, approche de la physiologie sous forme de systèmes: définition des éléments du système, échanges entre ces éléments, échanges avec d'autres systèmes et/ou le milieux extérieur.

Compétences visées : Maîtriser le vocabulaire associé aux principales fonctions du corps humain dans la perspective d'une communication efficace avec les professionnels du monde de la santé.

1) Locomotion et biomécanique du rachis
2) Sommeil normal et pathologique
3) Technologies informatiques et systèmes cardiovasculaires
4) Locomotion et biomécanique du rachis
5) Organe des sens
6) Physiologie de l'exercice
7) Biotechnologie de la thermodynamique et de la bioénergétique cardiaque
8) Sensibilité somatique et douleur

Understand the main functions of the human body, approach to physiology in the form of systems: definition of system elements, exchanges between these elements, exchanges with other systems and / or the external environment.

Skills targeted: Master the vocabulary associated with the main functions of the human body in the perspective of effective communication with medical professionals.

1) Locomotion and biomechanics of the spine
2) Normal and pathological sleep
3) Computer Technologies and Cardiovascular Systems
4) Locomotion and biomechanics of the spine
5) Body of the senses
6) Physiology of exercise
7) Biotechnology of cardiac thermodynamics and bioenergetics
8) Somatic sensitivity and pain

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Acquérir les concepts fondamentaux sous-jacents aux Réseaux de Santé, un des outils stratégiques dans l'organisation des soins au niveau national. Prendre conscience des différents aspects que peuvent recouvrir ces réseaux avec les évolutions futures envisagées. Découvrir, au cours d'une journée en médecine libéral, le point de vue d'un praticien.

Ce module est organisé en 7 cours. Le premier, a pour objet, d'exposer les principes génériques à  tout réseau de Santé. Les enseignements suivants rapportent différentes déclinaisons des réseaux de Santé selon le métier, que ce soit, dans le cadre de la télésanté (Quels services, enjeux et perspectives pour les territoires. Dernières avancées et retours d'expériences réussies), de l'Hospitalisation à  Domicile (Organisation et expériences en télémédecine), de soins de proximité dans le Vercors (une expérience d'organisation des soins de proximité en multidisciplinaire sur le territoire Vercors), de la maladie thrombo-embolique (l'expérience de GRANTED : le réseau grenoblois des pathologies vasculaires), du point de vue d'un industriel (MBAConsulting Réseau de Santé), ou encore du point de vue de la filière gériatrique (Réseau de soins, Filières, Structures, et Réseaux gériatriques).

Il est complété par une journée de stage en cabinet de médecine libérale, afin de pleinement appréhender la réalité pratique, l'ensemble des améliorations possibles et évolutions futures de ce domaine.

This module is organized into 7 lectures. The first aims at showing the generic principles of Health network. The following lectures are focused on different types of Health Network, including telemedicine, home care, community care, thromboembolic disease (GRANTED network), industrial point of view and geriatric point of view.

These lectures are illustred by a lesson in a medical center.

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- Représentation Temps-Fréquence des bio-signaux
- Maitrise des outils théoriques et d'algorithmes pour le traitement des signaux non-stationnaires

1. Signaux du vivant : un monde de signaux non-stationnaires
2. Limites de la Transformée de Fourier
3. Transformée de Fourier à  fenêtre
4. Transformée en ondelettes

Bureaux d'études :
- Spectrogramme
- Scalogramme
- Applications au traitement de signaux d'accélération glottique

- Time-frequency analysis of physiological signals
- Theoretical tools and numerical algorithms for non-stationary signals processing

1. Bio-signals : a world of non-stationnary signals
2. Fourier Transform limites
3. Short-time Fourier transform
4. Wavelet Transform

Practical works :
- Spectrogram
- Scalogram
- Applications to processing of accelerometric signals

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Comprendre les différents traitements sur l'image depuis son acquisition jusqu'à  l'extraction de caractéristiques.

- Introduction : du capteur à  l'image: contraintes liées à  l'échantillonnage et la quantification.
- Traitements de niveaux pixels : traitements pour la dynamique des niveaux de gris (ou couleurs)
- Filtrage linéaire spatial et fréquentiel
- Filtrage non-linéaire
- Segmentation contour et extractions de caractéristiques ( Transformée de Hough)
- Segmentation région (et extractions de caractéristiques (Méthodes morphologiques, Algorithmes de division-fusion)
- Notion d'Indexations d'images, cas en imagerie médicale
- Dernière partie : étapes de traitement d"images qui permettent d"analyser les données imagerie cérébrales anatomiques et fonctionnelles obtenues par IRM

- Introduction : sampling and quantization
- Low-level image processing
- Linear filtering (spatial and frequential)
- Non-linear filtering
- Edge segmentation (Hough transform)
- Region segmentation (morphological methods, split and merge algorithms)
- Image indexation

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À terme, ce module a vocation à  poursuivre ou compléter le projet d'Assistance à  la Maîtrise d'Ouvrage de TIS4.
Actuellement, les heures dédiées à  ce module sont consacrées à  la préparation du projet de fin d'études (TIS5). L'objectif est la rédaction d'un document type « proposition technique » décrivant le contexte, les enjeux, la compréhension du besoin, la solution, le pilotage, l'organisation et les engagements.

Travail en autonomie par groupe de 3 ou 4 étudiants dans les locaux de l'école.
Rédaction  d'une mission de cadrage, pour préparer la mission de réalisation (projet fin d'étude) :
- compréhension du besoin et des enjeux
- état de l'art
- solution proposée (maquettes, schémas, choix techniques)
- dispositif proposé (pilotage, localisation, charge et organisation de l'équipe)
- engagements pris  (délais, livrables, ...)

The objective is the writing of a type of document "technical proposal" describing the context, the stakes, the understanding of the need, the solution, the management, the organization and the commitments.

Self-employment by groups of 3 or 4 students in the school premises.
Writing a scoping mission, to prepare the mission of realization (end of study project):
- understanding the need and the issues
- state of the art
- proposed solution (models, diagrams, technical choices)
- proposed device (piloting, localization, charge and organization of the team)
- commitments made (deadlines, deliverables, ...)

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Capacité d'un étudiant à  s'intégrer en entreprise et à  assumer des fonctions d'ingénieurs.

22 semaines de stage

22 weeks in a company

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- Réalisation d'un projet en équipe
- Organisation et pilotage du projet
- Capacité technique de réalisation

Réalisation du projet en entreprise ou dans les locaux de l'école
3 audits intermédiaires par un jury enseignants
1 Soutenance finale (recette du projet)

- Realization of a team project
- Organization and project management
- Technical capacity of realization

Implementation of the project in a company or at school
3 inetrmédiaires audits by a jury teachers
1 Final Defense (receipt of the project)

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Cette UE correspond aux différentes périodes d'alternance qui ont lieu au cours du semestre universitaire numéro 9 (environ 10 semaines). Il s'agit donc des périodes en entreprise. Le bilan de ces périodes prend la forme d'un rapport qui sera défendu au cours d'une soutenance orale.

This unit corresponds to the different periods during which the student is present in a company during semester 9 (around 10 weeks). The évaluation of these periods take the form of a written report and an oral defense.

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Savoir identifier, adapter et mettre en œuvre des Design Patterns.

- Rôle des Design Patterns
- Étude des principaux Design Patterns
- Mise en œuvre des principaux Design Patterns

Know how to identify, adapt and implement Design Patterns.

- Role of Design Patterns
- Study of the main Design Patterns
- Implementation of the main Design Patterns

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Appréhender les différentes étapes permettant la conception, la réalisation et la validation de systèmes à  base de connaissances. Les méthodes et outils présentés permettront de préciser les apports liés à  la représentation de connaissances symboliques et incomplètes. Ce cours tient compte de la spécificité de la formation ingénierie de la santé, sans omettre pourtant de présenter les méthodes de façon générique.

Compétences visées :
Le web sémantique/web des données fournit un cadre général qui permet l'échange, le partage et la réutilisation de données entre applications au travers des entreprises et des communautés d'utilisateurs. C'est le fruit d'un effort collaboratif mené par le World Wide Web Consortium (W3C) avec la participation de nombreux partenaires issus du monde de la recherche et de l'industrie. Ce cours se focalisera sur certaines des technologies standardisées par le W3C et qui sont au cœur du web sémantique/ des données : RDF et SPARQL permettent l'échange et l'interrogation des données, RDFS et OWL offrent l'expressivité nécessaire à  la modélisation d'ontologies. La présentation en cours de ces différents langages sera complétée par des exercices pratiques sur machine (avec le framework Java Jena et l'éditeur d'ontologies Protégé-OWL) qui permettront aux étudiants de se confronter directement et concrètement avec la mise œuvre du web sémantique.

Ce cours vise les objectifs suivants :
    - présenter les principes à  la base du web sémantique
    - fournir les connaissances nécessaires à  la compréhension des technologies utilisées pour la mise en œuvre du web sémantique
    - présenter l'état actuel du développement du web sémantique
    - comprendre les défis techniques liés à  la réalisation du web sémantique
Au terme de ce cours, l'étudiant sera en mesure de :
   - saisir clairement les enjeux liés aux techniques du web sémantique
   - connaitre les principaux langages utilisés dans les applications du web sémantique
   - comprendre une architecture simple pour le web sémantique
   - construire une ontologie dans le but d'une intégration au web sémantique

Partie 1 : Ontologies et web sémantique/ web des données
Partie 2 : Représentation de connaissances incomplètes
- Intérêts et principe
- Représentation de connaissances incomplètes
- Raisonnement avec des connaissances incomplètes : principe de l'inférence bayésienne
- Méthodes de simplification symbolique pour l'inférence bayésienne
- Apprentissage à  partir de données

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- Introduction générale à  la modélisation en médecine et biologie
- Définition et apports de la modélisation en médecine et biologie, à  partir d'une thématique choisie (le thème abordé est la ventilation artificielle)
- Description et implémentation d'un modèle connu du système respiratoire
- Mise en place d'un simulateur d'assistance ventilatoire qui permettra de comparer les caractéristiques de différents modes d'assistance
- Utilisation de la modélisation pour l'analyse et la représentation de signaux physiologiques

Cours (4h) : Introduction à  la modélisation
Cours (2h) : Présentation de la thématique et du contexte de la ventilation artificielle
Rappel de cours et TP (4h) : Résolution numérique d'équations différentielles
TP (4 séances de 4h) : Projet d'assistance ventilatoire
TP (2 séances de 4h) : Interactions cardio-respiratoires, modélisation et représentation de signaux physiologiques

- General introduction to the modelling in medicine and biology
- Definition and contributions based on a chosen theme (artificial ventilation)
- Simulation of an existing model of spontaneous breathing
- Modelisation of the interactions with mechanical ventilation

Introduction to modelling and simulation
Presentation of the artificial ventilation context
Numerical resolution of differential equations
Project of ventilatory assistance
Cardio-respiratory interactions : Modelling and representation of physiological signals

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- Rappeler les principes d'une démarche qualité
- Présenter les principes et l'organisation de gestion des risques et de la qualité en établissement de santé
- Assurance qualité et normes

1. Principes généraux : place de l'assurance qualité dans le marquage CE
2. Principes généraux : Les concepts de l'assurance qualité
3a. Management du système Qualité en conformité avec la norme ISO 13485
3b. Système qualité en développement
3c. Norme IEC 62304
4. Maitrise de la sous-traitance
5. Exemple de système qualité
6. L'audit

- Principles of a quality approach
- Principles and organization of risk management and quality in health institutions
- Quality and standards

1. General principles: place of quality insurance in the CE marking
2. General principles: The concepts of quality insurance
3a. Quality system management in accordance with ISO 13485
3b. Quality system in development
3c. IEC 62304 standard
4. Subcontracting
5. Example of a quality system
6. Audit

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Introduction au domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO) du point de vue ingénierie.
Après une introduction aux problématiques cliniques, ce cours couvre un état de l'art succinct des méthodes utilisées pour l'analyse d'images médicales (images 3D), la fusion d'images multimodales, la planification et la simulation de procédures chirurgicales ainsi que la chirurgie assistée par ordinateur.
Un mini-projet permet aux étudiants d'inventer un dispositif de GMCAO fictif, mais réaliste, afin de répondre à  un besoin chirurgical précis.
Un séminaire permet une rencontre avec des cliniciens, industriels ou chercheurs. Ils exposent leurs problèmes, produits et solutions.

- Introduction
- Imagerie
- Recalage
- Modèles et Simulateurs de Tissus Mous
- Robotique Médicale
- Séminaire ECCAMI : plateforme, projets et industriels
- TP CamiTK

- Introduction
- Medical Imaging
- Image Registration
- Modeling and Simulation of Soft Tissue
- Medical Robotics
- ECCAMI workshop: plateform, projects and products
- Tutorial CamiTK

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Cette UE correspond aux différentes périodes d'alternance qui ont lieu au cours du semestre universitaire numéro 9 (environ 10 semaines). Il s'agit donc des périodes en entreprise. Le bilan de ces périodes prend la forme d'un rapport qui sera défendu au cours d'une soutenance orale.

This unit corresponds to the different periods during which the student is present in a company during semester 9 (around 10 weeks). The évaluation of these periods take the form of a written report and an oral defense.

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 Acquérir :
  - Culture générale des écosystèmes Big Data
  - Notions d'architecture et d'intégration
  - Méthode de conception d'un lac de données
  - Méthodes et outils pour la collecte, l'organisation et l'exploration interactive de données massives et/ou complexes
  - Savoir-faire l'implémentation d'une plate-forme d'exploration de données de santé centré sur une base graphe

PARTIE THÉORIQUE (8H)
Partie 1 : Introduction / Contexte
- Big Data : définitions
- Regroupement de données
- Approche de construction d'un lac de données : workflow associé
- Les démarches péri-informatiques (gouvernance, CNIL, ?)
- Les écosystèmes autour du Big Data
- Considérations techniques (montée en charge, haute disponibilité, redondance, ...)

Partie 2 : Mise en œuvre sur un Entrepôt de Données de Santé (EDS)
- Contexte CHU
- Approche projet
- Workflow de traitements : ETL, Traitement, Accès
- Un exemple d'architecture générale
- Quelques outils indispensables
- Exemple d'un projet de EDS au CHUGA

Partie 3 : Conception d'un lac de données
- Contexte, objectifs, moyens.
- Concepts des bases graphes
- Domaines courants d'application
- Interopérabilité, web sémantique
- Du modèle à  la base orientée graphe
- Modèle pivot du lac, évolutions

Partie 4 : Implémentation d'une plate-forme interactive d'exploration de données complexes et massives
- Focus ArangoDB, Elastic, ETL, IHM
- Élaboration de données métier

PARTIE PRATIQUE (14H)
Partie 5 : Exercice de modélisation (2H)

Partie 6 : Mini-projet (12H)
Déployer un workflow de traitement de données : ETL, BD Graphe, Visualisation

Bilan des connaissances acquises (2H)

Acquire:
- General Culture of Big Data Ecosystems
- Architecture and integration concepts
- Method of designing a data lake
- Methods and tools for collecting, organizing and interactive exploration of massive and / or complex data
- Know-how implementation of a health data mining platform centered on a graph database.

THEORICAL PART (8H)
Part 1: Introduction / Background
- Big Data: Definitions
- Grouping of data
- Approach to build a data lake: associated workflow
- Peri-computing approaches (governance, privacy, ...)
- The eco-systems around Big Data
- Technical considerations (scalability, high availability, redundancy, ...)

Part 2: Implementation of a Health Data Warehouse (DHS)
- University Hospital of Grenoble Context
- Project approach
- Treatment Workflow: ETL, Treatment, Access
- An example of a general architecture
- Some indispensable tools
- Health Data Warehouse project example at the University Hospital of Grenoble

Part 3: Designing a data lake
- Context, objectives, means.
- Concepts of graph oriented databases
- Common areas of application
- Interoperability, semantic web
- From the model to the graph oriented database
- Pivot model of the lake, evolutions

Part 4: Implementation of an interactive platform for complex and massive data mining
- Focus ArangoDB, Elastic, ETL, HMI
- Business Data Development

PRACTICAL PART (14H)
Part 5: Modeling Exercise (2H)

Part 6: Mini-Project (12H)
Deploy a data processing workflow: ETL, BD Graph, Visualization

Assessment of acquired knowledge (2H)

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Savoir identifier, adapter et mettre en œuvre des Design Patterns.

- Rôle des Design Patterns
- Étude des principaux Design Patterns
- Mise en œuvre des principaux Design Patterns

Know how to identify, adapt and implement Design Patterns.

- Role of Design Patterns
- Study of the main Design Patterns
- Implementation of the main Design Patterns

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- Rappeler les principes d'une démarche qualité
- Présenter les principes et l'organisation de gestion des risques et de la qualité en établissement de santé
- Assurance qualité et normes

1. Principes généraux : place de l'assurance qualité dans le marquage CE
2. Principes généraux : Les concepts de l'assurance qualité
3a. Management du système Qualité en conformité avec la norme ISO 13485
3b. Système qualité en développement
3c. Norme IEC 62304
4. Maitrise de la sous-traitance
5. Exemple de système qualité
6. L'audit

- Principles of a quality approach
- Principles and organization of risk management and quality in health institutions
- Quality and standards

1. General principles: place of quality insurance in the CE marking
2. General principles: The concepts of quality insurance
3a. Quality system management in accordance with ISO 13485
3b. Quality system in development
3c. IEC 62304 standard
4. Subcontracting
5. Example of a quality system
6. Audit

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Introduction au domaine des Gestes Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO) du point de vue ingénierie.
Après une introduction aux problématiques cliniques, ce cours couvre un état de l'art succinct des méthodes utilisées pour l'analyse d'images médicales (images 3D), la fusion d'images multimodales, la planification et la simulation de procédures chirurgicales ainsi que la chirurgie assistée par ordinateur.
Un mini-projet permet aux étudiants d'inventer un dispositif de GMCAO fictif, mais réaliste, afin de répondre à  un besoin chirurgical précis.
Un séminaire permet une rencontre avec des cliniciens, industriels ou chercheurs. Ils exposent leurs problèmes, produits et solutions.

- Introduction
- Imagerie
- Recalage
- Modèles et Simulateurs de Tissus Mous
- Robotique Médicale
- Séminaire ECCAMI : plateforme, projets et industriels
- TP CamiTK

- Introduction
- Medical Imaging
- Image Registration
- Modeling and Simulation of Soft Tissue
- Medical Robotics
- ECCAMI workshop: plateform, projects and products
- Tutorial CamiTK

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Cette UE correspond aux différentes périodes d'alternance qui ont lieu au cours du semestre universitaire numéro 9 (environ 10 semaines). Il s'agit donc des périodes en entreprise. Le bilan de ces périodes prend la forme d'un rapport qui sera défendu au cours d'une soutenance orale.

This unit corresponds to the different periods during which the student is present in a company during semester 9 (around 10 weeks). The évaluation of these periods take the form of a written report and an oral defense.