Master Biodiversité, écologie, évolution

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Acquisition de méthodes statistiques d’analyse des données et méthodes de représentation des données dans l’espace et d’analyses spatiales dans le contexte de l’environnement.
Initiation à la cartographie (SIG : modèles numériques de terrain, rappels de cartographie, principe de biogéographie).
Introduction aux statistiques spatiales et applications aux données environnementales.
Modèles linéaires généralisés et modèles à effets mixtes.

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Présentation des métiers de la recherche, des organismes de recherche publique et les modalités de concours.

Missions, évaluation et carrière des chercheurs.

La thèse : présentation de l’Ecole Doctorale ; les allocations de recherche et les modalités d’attribution.

Méthodologie d’analyse bibliographique et de rédaction d’un article de synthèse scientifique.

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L’objectif de cette UE est d’amener à réfléchir à la modélisation mathématique de données environnementales, écologiques ou génomiques.

1/  Programmation avancée 

2/  Introduction aux modèles markoviens - Chaînes de Markov, chaînes de Markov cachées

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Cours Magistraux :

Les intervenants sont des spécialistes des thématiques traitées dans l’UE, chercheurs et ingénieurs de recherche. Les interventions concernent :

- Théorie de la niche et écologie fonctionnelle
- Écologie du paysage et analyse des patrons de diversité des communautés
- Modélisation et analyse des distributions des espèces et écosystèmes, selon les conditions environnementales présentes et futures
- Macroécologie et théorie neutre de la biogéographie
- Réseaux écologiques
- Dynamique des écosystèmes
- Théorie de la coexistence
- Test d'hypothèses et inférence de processus d'assemblage
- Ecologie du paysage et modèles de métapopulations

Travaux Dirigés :

L’UE comporte plusieurs séances de travaux dirigés mettant en application les concepts et méthodes abordés en cours à l’application de données réelles :

- Modélisation et analyses de données de biodiversité avec R
- Modèles de Distribution d’Espèces (SDM) avec BIOMOD
- Modèles de métapopulation

Par ailleurs les étudiants effectuent l’analyse critique d’un article scientifique portant sur une des thématiques abordées dans l’UE. Ils présentent à l’oral le contenu de l’article et leur analyse.

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Les étudiants effectuent au début du semestre un stage au col du Lautaret de 5 jours. Au cours du stage ils découvrent les projets scientifiques qui sont menés dans le secteur, et conçoivent en lien avec l’équipe encadrante un mini-projet de recherche sur une des problématiques présentées. Certaines données déjà disponibles sont fournies, et les étudiants sont amenés à acquérir d’autres données requises au cours du stage. Au cours du semestre, les étudiants développent les analyses, l’interprétation et la discussion de leurs résultats, avec l’aide des enseignants dans le cadre de séances de tutorat.

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UE de formation sur les méthodes de remédiation des matrices polluées en utilisant les organismes vivants (biodégradation, mycoremédiation, phytoremédiation des polluants organiques et métalliques, constructed wetlands,...). L'enseignement est à la fois fondamental (mécanismes physiologiques et biochimiques mis en jeu dans les organismes pour absorber/dégrader les polluants) et appliqué (intervenant professionnel : chargé de mission en remédiation, ingénierie du traitement des eaux).

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Aborder l’écotoxicologie à différents niveaux d’intégration biologique:

- Xénobiotiques, absorption, transferts, métabolisation

- Écotoxicologie : aspects populationnels 

- Écotoxicologie et développement

- Xénobiotiques, risques écologiques et gestion durable

- OMICS appliqués à l’écotoxicologie

- Métabolomique et écotoxicologie

- Biomarqueurs et adaptation en milieu aquatique

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Cours Magistraux :

•  Les acteurs à différentes échelles de la conservation de la biodiversité et de l’inventaire naturaliste
• Qu’est ce qu’un protocole d’inventaire ? Protocoles et techniques d’inventaires : diversité et standardisation. 
• La donnée naturaliste : convention ; données et métadonnées ; standardisation.
• Les principes de la construction d’un protocole et mise en place concrète de protocoles ciblés sur certains groupes taxonomiques.
• Entomologie : diversité des insectes – Caractéristiques biologiques, morphologiques et anatomiques des principaux ordres. Déterminations d’insectes.
• Systèmes de gestion de Bases de Données relationnelles: présentation et conception d’une base de données inventaires naturalistes.

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https://disrupt-campus.univ-grenoble-alpes.fr/nos-formations/green-university/

Cette formation vous propose :

- Deux semaines de formation intensive afin de vous préparer aux enjeux du changement climatique

- De vous accompagner tout au long de l'année dans la mise en œuvre de votre projet sur les sites universitaires grenoblois

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Cours Magistraux :

-Introduction à la coordination et animation de rencontre et débats à enjeux
-Introduction à l’écriture d’un article de vulgarisation scientifique

Travaux Dirigés :

-Structuration d’un dossier d’articles de vulgarisation scientifiques sur les thèmes d’actualité dont ceux portés à l’occasion de la Fêtes des Sciences
-Aide à l’identification des ressources clefs dans la presse et les articles scientifiques (mises en pratiques des méta-analyses/grille de lecture étudiés en 1ere année avec les revues systématiques)
-Co-construction des interventions/rencontres avec les acteurs du territoire/socio-professionnels

Travaux Pratiques :

-Coordination et animation d’une rencontre avec 3 acteurs du territoire/socio-professionnels sur les sujets d’actualités et enjeux de la crise écologique et environnementale, en lien avec les politiques publiques et/ou les pratiques du secteur privé

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Le stage porte sur un projet scientifique complet, depuis la formulation d’une problématique, la mise en œuvre d’une méthodologie adaptée, et une analyse critique des résultats.

Il est réalisé dans des laboratoires ou organismes publics ou privés.

La durée de stage est au minimum de 5 mois.

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Cours Magistraux :

Méthodologie et outils d’analyse bibliographique.
Méthodologie de rédaction d’un article de synthèse scientifique.

Travaux Dirigés :

Nature : analyse d’articles scientifiques et synthèse sous forme d’un article scientifique, participation à des séminaires scientifiques.
Modalité : Travail personnel en séance.

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Le cours d'anglais en M2 s'appuie sur le travail de révision des bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2 et consolidé en L3 avec des supports traitant de sujets du domaine d’étude des étudiants. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, prendre des notes, et écrire un résumé) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

Ce module est également la finalisation de la validation à un niveau B2 des trois compétences définies par ALTE (Association of Language Testers in Europe) qui sont nécessaires pour continuer en thèse ou être efficace dans son travail.

Les trois compétences sont les suivantes :

• Est capable de faire un exposé clair sur un sujet connu et répondre à des questions factuelles prévisibles.
• Est capable de parcourir un texte pour retrouver l’information pertinente et en saisir l’essentiel.
• Est capable de prendre des notes simples et en faire un raisonnable usage pour écrire un rapport, un résumé ou faire une révision.

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Choix d'un ETC si niveau anglais >= B2

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 Cours Magistraux :

Généralités sur la géomatique
Éléments de cartographie (typologie de cartes, échelles, coordonnées et systèmes de projection).

Travaux Dirigés :

Stage terrain Lautaret (Inventaires entomologiques et botaniques pour application en SIG.).
Prise en main du logiciel Arcgis 10. 2.

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Instructions théoriques sur la gestion de la biodiversité et des ressources renouvelables, notamment en zone de montagne.

Gestion des écosystèmes humides et aquatiques, réintroduction d’espèces, grands prédateurs, trames vertes et bleues, Zone Natura 2000.

 Pour quels métiers? : Bureaux d’étude, collectivités territoriales, parcs et réserves

Programme : 

* Méthodes de diagnostic et de gestion des espaces forestiers, pelouses alpines, cours d'eau, plans d'eau, milieux alluviaux, zones humides, sols, faune, flore et habitats, espèces invasives.

* Utilisation d’indicateurs biologiques et gestion durable des milieux : définition d’un état initial, échelles de perception, histoire de l’utilisation des terres, les services des écosystèmes, partage de la ressource, conservation, réhabilitation/création de milieu neuf, revégétalisation, remédiation, méthodes d'inventaire et de suivi...

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Historique du Droit de l’Environnement en France (y compris règlements européens et internationaux concernant la France).

L’objectif et de porter à la connaissance (sans grands détails) des étudiants les principaux textes dans tous les domaines de l’Environnement.

Seuls les textes concernant la protection du milieu naturel seront ensuite abordés en détail avec leurs implications en termes de gestion, au cours de thématiques spécialisées.

Des interventions sont prévues sur les mesures compensatoires, sur  les statuts de protection, sur les Directives cadres sur l’Eau et sur les Habitats, sur la réglementation sur les produits chimiques (REACH)…

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Sept sorties sur le terrain permettent aux M2 GE une mise en situation sur des plans de gestion environnementaux sur des sites typiques (forets, parc naturel, marais tourbeux, ripisylves, plaines alluviales, Natura 2000, ENS, Arrêté de Biotope…) et des enjeux conservatoires (restauration des berges de l'Isère, Protection des vieux boisements, réhabilitation de milieux aquatiques, Gestion zones humide).

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Cours Magistraux :

Les intervenants sont des spécialistes des thématiques traitées dans l’UE, chercheurs et ingénieurs de recherche. Les interventions concernent :

- Théorie de la niche et écologie fonctionnelle
- Écologie du paysage et analyse des patrons de diversité des communautés
- Modélisation et analyse des distributions des espèces et écosystèmes, selon les conditions environnementales présentes et futures
- Macroécologie et théorie neutre de la biogéographie
- Réseaux écologiques
- Dynamique des écosystèmes
- Théorie de la coexistence
- Test d'hypothèses et inférence de processus d'assemblage
- Ecologie du paysage et modèles de métapopulations

Travaux Dirigés :

L’UE comporte plusieurs séances de travaux dirigés mettant en application les concepts et méthodes abordés en cours à l’application de données réelles :

- Modélisation et analyses de données de biodiversité avec R
- Modèles de Distribution d’Espèces (SDM) avec BIOMOD
- Modèles de métapopulation

Par ailleurs les étudiants effectuent l’analyse critique d’un article scientifique portant sur une des thématiques abordées dans l’UE. Ils présentent à l’oral le contenu de l’article et leur analyse.

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UE de formation sur les méthodes de remédiation des matrices polluées en utilisant les organismes vivants (biodégradation, mycoremédiation, phytoremédiation des polluants organiques et métalliques, constructed wetlands,...). L'enseignement est à la fois fondamental (mécanismes physiologiques et biochimiques mis en jeu dans les organismes pour absorber/dégrader les polluants) et appliqué (intervenant professionnel : chargé de mission en remédiation, ingénierie du traitement des eaux).

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Cours Magistraux :

•  Les acteurs à différentes échelles de la conservation de la biodiversité et de l’inventaire naturaliste
• Qu’est ce qu’un protocole d’inventaire ? Protocoles et techniques d’inventaires : diversité et standardisation. 
• La donnée naturaliste : convention ; données et métadonnées ; standardisation.
• Les principes de la construction d’un protocole et mise en place concrète de protocoles ciblés sur certains groupes taxonomiques.
• Entomologie : diversité des insectes – Caractéristiques biologiques, morphologiques et anatomiques des principaux ordres. Déterminations d’insectes.
• Systèmes de gestion de Bases de Données relationnelles: présentation et conception d’une base de données inventaires naturalistes.

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https://disrupt-campus.univ-grenoble-alpes.fr/nos-formations/green-university/

Cette formation vous propose :

- Deux semaines de formation intensive afin de vous préparer aux enjeux du changement climatique

- De vous accompagner tout au long de l'année dans la mise en œuvre de votre projet sur les sites universitaires grenoblois

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Cours Magistraux :

-Introduction à la coordination et animation de rencontre et débats à enjeux
-Introduction à l’écriture d’un article de vulgarisation scientifique

Travaux Dirigés :

-Structuration d’un dossier d’articles de vulgarisation scientifiques sur les thèmes d’actualité dont ceux portés à l’occasion de la Fêtes des Sciences
-Aide à l’identification des ressources clefs dans la presse et les articles scientifiques (mises en pratiques des méta-analyses/grille de lecture étudiés en 1ere année avec les revues systématiques)
-Co-construction des interventions/rencontres avec les acteurs du territoire/socio-professionnels

Travaux Pratiques :

-Coordination et animation d’une rencontre avec 3 acteurs du territoire/socio-professionnels sur les sujets d’actualités et enjeux de la crise écologique et environnementale, en lien avec les politiques publiques et/ou les pratiques du secteur privé

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Stage en dans une structure de gestion de la biodiversité.

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Le cours d'anglais en M2 s'appuie sur le travail de révision des bases lexicales et grammaticales de l'anglais scientifique et technique fait en L2 et consolidé en L3 avec des supports traitant de sujets du domaine d’étude des étudiants. Il vise à la fois à développer des compétences de communication en anglais scientifique (s'exprimer en public, prendre des notes, et écrire un résumé) et à maîtriser des tâches spécifiques liées à une séance de travaux pratiques (description de manipulations, de graphiques et de processus).

Ce module est également la finalisation de la validation à un niveau B2 des trois compétences définies par ALTE (Association of Language Testers in Europe) qui sont nécessaires pour continuer en thèse ou être efficace dans son travail.

Les trois compétences sont les suivantes :

• Est capable de faire un exposé clair sur un sujet connu et répondre à des questions factuelles prévisibles.
• Est capable de parcourir un texte pour retrouver l’information pertinente et en saisir l’essentiel.
• Est capable de prendre des notes simples et en faire un raisonnable usage pour écrire un rapport, un résumé ou faire une révision.

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Choix d'un ETC si niveau anglais >= B2

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